66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_02223 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_003538  putative membrane protein of ExoQ family involved in exopolysaccharide production  81.02 
 
 		 454 aa  706    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02223  hypothetical protein  100 
 
 		 461 aa  921    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0301  O-antigen polymerase  56.36 
 
 		 464 aa  462  1e-129  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1955  O-antigen polymerase  25.39 
 
 		 468 aa  86.3  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.324728  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0300  O-antigen polymerase  29.17 
 
 		 446 aa  78.6  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3094  O-antigen polymerase  29.62 
 
 		 444 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0119  O-antigen polymerase  25.41 
 
 		 466 aa  77  0.0000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0582  O-antigen polymerase  26.09 
 
 		 454 aa  76.6  0.0000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.814347  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2459  O-antigen polymerase  24.79 
 
 		 437 aa  73.9  0.000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3268  wzy family polymerase, exosortase system type 1 associated  25.47 
 
 		 452 aa  72.4  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.869746  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2412  hypothetical protein  25.59 
 
 		 444 aa  71.2  0.00000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2530  wzy family polymerase, exosortase system type 1 associated  30.63 
 
 		 463 aa  70.5  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.42287  normal  0.0601314 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0152  hypothetical protein  28.79 
 
 		 389 aa  70.5  0.00000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0297  hypothetical protein  23.8 
 
 		 428 aa  69.3  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.515931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1184  O-antigen polymerase  26.61 
 
 		 412 aa  68.9  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2338  O-antigen polymerase  25.19 
 
 		 425 aa  68.6  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0677  O-antigen polymerase  27.18 
 
 		 436 aa  68.2  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.857845  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3018  O-antigen polymerase  24.68 
 
 		 446 aa  65.5  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3103  O-antigen polymerase  23.95 
 
 		 498 aa  65.1  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.313581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1788  O-antigen polymerase  25.2 
 
 		 446 aa  61.2  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3061  O-antigen polymerase  29.71 
 
 		 465 aa  61.6  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.433121  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1558  O-antigen polymerase  28.69 
 
 		 472 aa  61.6  0.00000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.238347  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2212  O-antigen polymerase  22.96 
 
 		 415 aa  61.6  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0880149  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1654  O-antigen polymerase  28.71 
 
 		 754 aa  61.2  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0024  O-antigen polymerase  30.97 
 
 		 456 aa  60.8  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3579  O-antigen polymerase  21.23 
 
 		 501 aa  60.1  0.00000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1650  hypothetical protein  36.3 
 
 		 404 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.192586  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5004  O-antigen polymerase family protein  25 
 
 		 436 aa  58.9  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18850  O-antigen polymerase  27.62 
 
 		 393 aa  58.2  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3695  hypothetical protein  35.56 
 
 		 404 aa  57.8  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2455  O-antigen polymerase  26.62 
 
 		 435 aa  57.8  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0818595  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1682  hypothetical protein  28.27 
 
 		 404 aa  56.6  0.0000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2886  O-antigen ligase-like  27.32 
 
 		 414 aa  55.8  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000199013  normal  0.062273 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1614  hypothetical protein  34.07 
 
 		 404 aa  56.2  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.363158  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1468  secreted polysaccharide polymerase  34.07 
 
 		 404 aa  56.2  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00102355  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2384  O-antigen polymerase  25.8 
 
 		 436 aa  56.2  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.486663  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1496  hypothetical protein  34.07 
 
 		 404 aa  56.2  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.285071  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2638  O-antigen polymerase  26.46 
 
 		 428 aa  54.3  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2375  O-antigen polymerase  26.99 
 
 		 500 aa  53.9  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2363  hypothetical protein  25.28 
 
 		 431 aa  53.5  0.000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2960  O-antigen polymerase  28.51 
 
 		 436 aa  52.8  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.12688  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4116  O-antigen polymerase  29.09 
 
 		 540 aa  51.2  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0014553  hitchhiker  0.00000561153 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4957  O-antigen polymerase  23.51 
 
 		 470 aa  50.8  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0142  O-antigen polymerase  23.51 
 
 		 496 aa  50.4  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01295  secreted polysaccharide polymerase  33.04 
 
 		 385 aa  50.4  0.00006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0508  O-antigen polymerase  37.97 
 
 		 440 aa  50.1  0.00009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4286  inorganic carbon transporter  23.74 
 
 		 457 aa  50.1  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.816665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4227  O-antigen polymerase  23.96 
 
 		 457 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4434  O-antigen polymerase  30.38 
 
 		 474 aa  49.7  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1639  hypothetical protein  26.75 
 
 		 447 aa  48.5  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3077  O-antigen polymerase  25.47 
 
 		 504 aa  48.5  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2821  O-antigen polymerase  23.35 
 
 		 434 aa  47  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1087  O-antigen polymerase  25 
 
 		 612 aa  46.6  0.0008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3113  O-antigen polymerase  29.87 
 
 		 467 aa  45.8  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000265772  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3256  O-antigen polymerase  29.46 
 
 		 1025 aa  46.2  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.711295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3580  O-antigen polymerase  27.18 
 
 		 504 aa  45.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2009  O-antigen polymerase  31.73 
 
 		 459 aa  44.7  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0822  inorganic carbon transporter  26.47 
 
 		 471 aa  44.7  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.999427  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4268  O-antigen polymerase  25.49 
 
 		 503 aa  44.7  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.209068 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2177  EXOQ family/lipid A core O-antigen ligase  21.19 
 
 		 495 aa  44.3  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.42634  normal  0.835874 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2608  O-antigen polymerase  25.09 
 
 		 432 aa  43.9  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.212106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2896  O-antigen polymerase family protein  28.43 
 
 		 686 aa  43.9  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2516  O-antigen polymerase  28.43 
 
 		 686 aa  43.9  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.549504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4864  inorganic carbon transporter  27.91 
 
 		 467 aa  43.1  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.867776  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5389  O-antigen polymerase (wzy)  24.01 
 
 		 405 aa  43.5  0.009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.933006  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5249  O-antigen polymerase  23.55 
 
 		 671 aa  43.1  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.566036  normal  0.80633 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>