23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5249 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_5249  O-antigen polymerase  100 
 
 		 671 aa  1311    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.566036  normal  0.80633 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1497  O-antigen polymerase  73.66 
 
 		 672 aa  936    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3526  O-antigen polymerase  29.16 
 
 		 668 aa  155  2e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000131402  normal  0.176407 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3579  O-antigen polymerase  25.16 
 
 		 501 aa  70.5  0.00000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1955  O-antigen polymerase  25.63 
 
 		 468 aa  57  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.324728  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3103  O-antigen polymerase  30 
 
 		 498 aa  55.5  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.313581  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2459  O-antigen polymerase  29.19 
 
 		 437 aa  53.9  0.000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2375  O-antigen polymerase  23.83 
 
 		 500 aa  53.9  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3288  O-antigen polymerase  26 
 
 		 594 aa  50.4  0.00009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.709506  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5004  O-antigen polymerase family protein  26.15 
 
 		 436 aa  50.4  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0142  O-antigen polymerase  31.09 
 
 		 496 aa  49.7  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3905  O-antigen polymerase  25.49 
 
 		 456 aa  48.9  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4268  O-antigen polymerase  28.37 
 
 		 503 aa  48.1  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.209068 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3580  O-antigen polymerase  29.58 
 
 		 504 aa  47.8  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0678  hypothetical protein  25 
 
 		 594 aa  47.8  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.206131 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2478  O-antigen polymerase  37.76 
 
 		 415 aa  47.4  0.0009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0979  O-antigen polymerase  26.57 
 
 		 523 aa  45.4  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0753  O-antigen polymerase  28.34 
 
 		 476 aa  44.7  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.409596  hitchhiker  0.000594246 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1729  hypothetical protein  28.21 
 
 		 486 aa  44.7  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0818924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3774  O-antigen polymerase  27.04 
 
 		 439 aa  44.3  0.007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0152  hypothetical protein  28.4 
 
 		 389 aa  44.3  0.008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1691  O-antigen polymerase  25.5 
 
 		 512 aa  43.9  0.009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.121195  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0559  hypothetical protein  31.02 
 
 		 569 aa  43.9  0.01  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.261302  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>