41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3077 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_3078  O-antigen polymerase  69.53 
 
 		 500 aa  691    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3077  O-antigen polymerase  100 
 
 		 504 aa  1018    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2384  O-antigen polymerase  25.48 
 
 		 436 aa  86.3  0.000000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.486663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2009  O-antigen polymerase  20.64 
 
 		 459 aa  64.3  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2459  O-antigen polymerase  28.96 
 
 		 437 aa  61.6  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1788  O-antigen polymerase  26.19 
 
 		 446 aa  60.5  0.00000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0142  O-antigen polymerase  24.34 
 
 		 496 aa  55.5  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0301  O-antigen polymerase  26.46 
 
 		 464 aa  55.1  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4268  O-antigen polymerase  32.73 
 
 		 448 aa  55.1  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5004  O-antigen polymerase family protein  26.03 
 
 		 436 aa  53.9  0.000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3695  hypothetical protein  31.19 
 
 		 404 aa  53.9  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1650  hypothetical protein  30.69 
 
 		 404 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.192586  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2960  O-antigen polymerase  28.48 
 
 		 436 aa  52.4  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.12688  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02223  hypothetical protein  25 
 
 		 461 aa  52  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1496  hypothetical protein  28.99 
 
 		 404 aa  51.6  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.285071  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1468  secreted polysaccharide polymerase  28.99 
 
 		 404 aa  51.2  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00102355  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1614  hypothetical protein  28.99 
 
 		 404 aa  51.6  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.363158  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3103  O-antigen polymerase  29.76 
 
 		 498 aa  49.7  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.313581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2412  hypothetical protein  28.32 
 
 		 444 aa  50.1  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3061  O-antigen polymerase  25 
 
 		 465 aa  48.9  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.433121  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1682  hypothetical protein  28.23 
 
 		 404 aa  49.3  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3696  O-antigen polymerase  22.64 
 
 		 461 aa  48.5  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.312837 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2808  O-antigen polymerase  25.68 
 
 		 494 aa  48.5  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1351  O-antigen polymerase  27.83 
 
 		 448 aa  48.5  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2530  wzy family polymerase, exosortase system type 1 associated  26.84 
 
 		 463 aa  48.1  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.42287  normal  0.0601314 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0024  O-antigen polymerase  24.19 
 
 		 456 aa  47.4  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1955  O-antigen polymerase  25.21 
 
 		 468 aa  47.4  0.0007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.324728  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0119  O-antigen polymerase  23.29 
 
 		 466 aa  46.6  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0227  hypothetical protein  30.07 
 
 		 460 aa  46.6  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.604472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0279  bicarbonate transporter  29.02 
 
 		 438 aa  45.4  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3179  O-antigen polymerase  27.01 
 
 		 453 aa  45.8  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.579286  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3597  O-antigen polymerase  24.06 
 
 		 438 aa  45.1  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.312058 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0297  hypothetical protein  25.34 
 
 		 428 aa  45.1  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.515931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3094  O-antigen polymerase  28.76 
 
 		 444 aa  45.1  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003538  putative membrane protein of ExoQ family involved in exopolysaccharide production  25.38 
 
 		 454 aa  44.7  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3268  wzy family polymerase, exosortase system type 1 associated  32.19 
 
 		 452 aa  43.9  0.007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.869746  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2638  O-antigen polymerase  23.17 
 
 		 428 aa  43.9  0.007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3580  O-antigen polymerase  23.96 
 
 		 504 aa  43.9  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2018  O-antigen polymerase  33.33 
 
 		 523 aa  43.5  0.009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000808268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2712  O-antigen polymerase  24.78 
 
 		 413 aa  43.5  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0646679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4116  O-antigen polymerase  26.95 
 
 		 540 aa  43.5  0.01  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0014553  hitchhiker  0.00000561153 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>