69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_2384 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_2384  O-antigen polymerase  100 
 
 
436 aa  875    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.486663  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1822  O-antigen polymerase  34.51 
 
 
461 aa  204  2e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.831736  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2933  O-antigen polymerase  33.96 
 
 
458 aa  201  3e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000205816  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0103  O-antigen polymerase  30.9 
 
 
492 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1362  O-antigen polymerase  34.27 
 
 
425 aa  135  9.999999999999999e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.185241  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2333  O-antigen polymerase  29.11 
 
 
431 aa  109  9.000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.964533  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4227  O-antigen polymerase  28.71 
 
 
457 aa  90.9  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4286  inorganic carbon transporter  28.71 
 
 
457 aa  90.9  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.816665  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18850  O-antigen polymerase  25.45 
 
 
393 aa  90.9  4e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4116  O-antigen polymerase  30.07 
 
 
540 aa  89.4  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0014553  hitchhiker  0.00000561153 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0142  O-antigen polymerase  25.51 
 
 
496 aa  84.7  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3077  O-antigen polymerase  25.48 
 
 
504 aa  84.7  0.000000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3113  O-antigen polymerase  23.82 
 
 
467 aa  82  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000265772  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3696  O-antigen polymerase  26.44 
 
 
461 aa  80.9  0.00000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.312837 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2009  O-antigen polymerase  20.92 
 
 
459 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4864  inorganic carbon transporter  27.36 
 
 
467 aa  76.6  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.867776  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0822  inorganic carbon transporter  24.27 
 
 
471 aa  76.3  0.0000000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.999427  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2327  O-antigen polymerase  26.86 
 
 
475 aa  74.3  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3078  O-antigen polymerase  24.7 
 
 
500 aa  72  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4268  O-antigen polymerase  26.81 
 
 
503 aa  71.6  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.209068 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2694  O-antigen polymerase  25.66 
 
 
532 aa  70.5  0.00000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00327343  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4957  O-antigen polymerase  26.47 
 
 
470 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3579  O-antigen polymerase  27.27 
 
 
501 aa  65.5  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1088  O-antigen polymerase  26.01 
 
 
737 aa  64.7  0.000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0357  inorganic carbon transporter  22.59 
 
 
467 aa  63.5  0.000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.152421  normal  0.510876 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3580  O-antigen polymerase  23.48 
 
 
504 aa  61.2  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4434  O-antigen polymerase  22.44 
 
 
474 aa  61.6  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1869  O-antigen polymerase  27.24 
 
 
459 aa  60.5  0.00000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3371  O-antigen polymerase  24.26 
 
 
413 aa  60.5  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0648  hypothetical protein  24.6 
 
 
462 aa  60.1  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.600049  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02223  hypothetical protein  25.8 
 
 
461 aa  56.6  0.0000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0714  O-antigen polymerase  26.01 
 
 
781 aa  56.6  0.0000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5004  O-antigen polymerase family protein  26.33 
 
 
436 aa  55.1  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3103  O-antigen polymerase  26.67 
 
 
498 aa  53.9  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.313581  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1087  O-antigen polymerase  22.5 
 
 
612 aa  53.5  0.000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0301  O-antigen polymerase  23.48 
 
 
464 aa  53.1  0.000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2459  O-antigen polymerase  26.11 
 
 
437 aa  52.8  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0152  hypothetical protein  23.69 
 
 
389 aa  52  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24401  bicarbonate transporter, ICT family protein  29.19 
 
 
436 aa  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3094  O-antigen polymerase  29.81 
 
 
444 aa  51.6  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2338  O-antigen polymerase  22.73 
 
 
425 aa  51.2  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1654  O-antigen polymerase  22.51 
 
 
754 aa  51.2  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1384  TPR repeat-containing protein  25.52 
 
 
870 aa  51.2  0.00004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000149301  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2212  O-antigen polymerase  26.55 
 
 
415 aa  50.8  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0880149  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2800  O-antigen polymerase  27.49 
 
 
422 aa  50.4  0.00006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003538  putative membrane protein of ExoQ family involved in exopolysaccharide production  24.51 
 
 
454 aa  50.1  0.00007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0654  O-antigen polymerase  23.26 
 
 
480 aa  50.1  0.00008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00317709 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0198  O-antigen polymerase  26.05 
 
 
874 aa  49.7  0.00009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0024  O-antigen polymerase  25.67 
 
 
456 aa  49.3  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0168  hypothetical protein  23.26 
 
 
494 aa  49.3  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4567  O-antigen polymerase  27.39 
 
 
717 aa  49.3  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.79744  normal  0.181696 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13891  hypothetical protein  21.5 
 
 
416 aa  48.9  0.0002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0279  bicarbonate transporter  26.95 
 
 
438 aa  48.1  0.0003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0364  O-antigen polymerase  28.48 
 
 
428 aa  47.8  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2813  O-antigen polymerase  22.48 
 
 
773 aa  47  0.0007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.192356  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3726  O-antigen polymerase  24.88 
 
 
438 aa  47  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.114038 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1691  O-antigen polymerase  22.58 
 
 
512 aa  46.6  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.121195  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2455  O-antigen polymerase  24.1 
 
 
435 aa  45.8  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0818595  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1955  O-antigen polymerase  27.8 
 
 
468 aa  44.7  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.324728  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5250  O-antigen polymerase  27.86 
 
 
336 aa  45.1  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3495  hypothetical protein  24.15 
 
 
617 aa  45.1  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000341769  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2722  O-antigen polymerase  26.57 
 
 
497 aa  44.7  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.616494  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0583  O-antigen polymerase  25 
 
 
449 aa  44.3  0.004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0127  hypothetical protein  27.27 
 
 
845 aa  44.7  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0051  O-antigen polymerase  26.45 
 
 
735 aa  44.7  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000539528  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2412  hypothetical protein  26.04 
 
 
444 aa  44.3  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4494  hypothetical protein  24.65 
 
 
447 aa  43.9  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00401546  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1788  O-antigen polymerase  23.02 
 
 
446 aa  43.5  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1436  O-antigen polymerase  25.56 
 
 
404 aa  43.5  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>