33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_3268 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_3268  wzy family polymerase, exosortase system type 1 associated  100 
 
 		 452 aa  901    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.869746  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0297  hypothetical protein  49.14 
 
 		 428 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.515931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0300  O-antigen polymerase  40.09 
 
 		 446 aa  318  1e-85  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0677  O-antigen polymerase  39.7 
 
 		 436 aa  298  1e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.857845  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1955  O-antigen polymerase  38.93 
 
 		 468 aa  288  1e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.324728  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2412  hypothetical protein  36.95 
 
 		 444 aa  271  2e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3094  O-antigen polymerase  38.83 
 
 		 444 aa  261  2e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0582  O-antigen polymerase  36.76 
 
 		 454 aa  258  1e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.814347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2530  wzy family polymerase, exosortase system type 1 associated  32.9 
 
 		 463 aa  226  9e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.42287  normal  0.0601314 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0119  O-antigen polymerase  32.61 
 
 		 466 aa  216  8e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2960  O-antigen polymerase  35.73 
 
 		 436 aa  213  3.9999999999999995e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.12688  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1558  O-antigen polymerase  33.54 
 
 		 472 aa  206  9e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.238347  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4820  O-antigen polymerase  25.36 
 
 		 487 aa  127  5e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.53889  normal  0.786094 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0227  hypothetical protein  25.28 
 
 		 460 aa  121  3e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.604472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3179  O-antigen polymerase  25.11 
 
 		 453 aa  114  4.0000000000000004e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.579286  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2363  hypothetical protein  25.52 
 
 		 431 aa  89.4  1e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0301  O-antigen polymerase  26.17 
 
 		 464 aa  77.4  0.0000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02223  hypothetical protein  25.47 
 
 		 461 aa  72.8  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003538  putative membrane protein of ExoQ family involved in exopolysaccharide production  26.43 
 
 		 454 aa  67  0.0000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2455  O-antigen polymerase  23.19 
 
 		 435 aa  64.7  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0818595  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2212  O-antigen polymerase  25.74 
 
 		 415 aa  61.2  0.00000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0880149  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3579  O-antigen polymerase  25.34 
 
 		 501 aa  52.8  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2459  O-antigen polymerase  23.43 
 
 		 437 aa  51.2  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0152  hypothetical protein  20.93 
 
 		 389 aa  50.8  0.00005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2338  O-antigen polymerase  22.35 
 
 		 425 aa  50.4  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1788  O-antigen polymerase  22.08 
 
 		 446 aa  50.1  0.00009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3103  O-antigen polymerase  26.84 
 
 		 498 aa  48.9  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.313581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2375  O-antigen polymerase  26.58 
 
 		 500 aa  47  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3537  membrane protein PslJ  29.89 
 
 		 471 aa  45.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0975897  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5004  O-antigen polymerase family protein  21.15 
 
 		 436 aa  44.7  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3077  O-antigen polymerase  32.19 
 
 		 504 aa  43.9  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18850  O-antigen polymerase  26.32 
 
 		 393 aa  43.5  0.008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01295  secreted polysaccharide polymerase  24.17 
 
 		 385 aa  43.5  0.008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>