84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2375 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2375  O-antigen polymerase  100 
 
 		 500 aa  999    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3103  O-antigen polymerase  79.76 
 
 		 498 aa  781    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.313581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3579  O-antigen polymerase  27.77 
 
 		 501 aa  190  4e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3526  O-antigen polymerase  31.43 
 
 		 668 aa  80.1  0.00000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000131402  normal  0.176407 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1497  O-antigen polymerase  26.79 
 
 		 672 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003538  putative membrane protein of ExoQ family involved in exopolysaccharide production  24.46 
 
 		 454 aa  71.2  0.00000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2018  O-antigen polymerase  26.1 
 
 		 456 aa  70.9  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4434  O-antigen polymerase  25.42 
 
 		 474 aa  70.5  0.00000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4116  O-antigen polymerase  26.26 
 
 		 540 aa  68.2  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0014553  hitchhiker  0.00000561153 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3401  polysaccharide deacetylase  25.7 
 
 		 464 aa  67.4  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.264275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02223  hypothetical protein  23.87 
 
 		 461 aa  67  0.0000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5004  O-antigen polymerase family protein  26.14 
 
 		 436 aa  65.5  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5249  O-antigen polymerase  27.59 
 
 		 671 aa  63.9  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.566036  normal  0.80633 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1955  O-antigen polymerase  30.12 
 
 		 468 aa  63.5  0.000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.324728  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4864  inorganic carbon transporter  28.24 
 
 		 467 aa  63.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.867776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0297  hypothetical protein  27.56 
 
 		 428 aa  61.2  0.00000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.515931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0301  O-antigen polymerase  26.24 
 
 		 464 aa  60.5  0.00000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2212  O-antigen polymerase  26.72 
 
 		 415 aa  60.5  0.00000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0880149  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2694  O-antigen polymerase  25 
 
 		 532 aa  58.2  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00327343  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0142  O-antigen polymerase  26.84 
 
 		 496 aa  57.8  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0152  hypothetical protein  31.06 
 
 		 389 aa  57  0.0000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0714  O-antigen polymerase  22.29 
 
 		 781 aa  56.2  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2412  hypothetical protein  28.98 
 
 		 444 aa  56.6  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0119  O-antigen polymerase  25.83 
 
 		 466 aa  55.5  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0822  inorganic carbon transporter  22.01 
 
 		 471 aa  54.7  0.000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.999427  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0480  hypothetical protein  25.42 
 
 		 452 aa  54.3  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3268  wzy family polymerase, exosortase system type 1 associated  26.77 
 
 		 452 aa  53.5  0.000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.869746  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3113  O-antigen polymerase  22.36 
 
 		 467 aa  53.5  0.000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000265772  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2384  O-antigen polymerase  22.49 
 
 		 436 aa  52.8  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.486663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3347  O-antigen polymerase  33.58 
 
 		 443 aa  53.1  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0103  O-antigen polymerase  27.8 
 
 		 492 aa  52.8  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0300  O-antigen polymerase  21.59 
 
 		 446 aa  53.1  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4268  O-antigen polymerase  26.87 
 
 		 503 aa  53.1  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.209068 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2530  wzy family polymerase, exosortase system type 1 associated  27.27 
 
 		 463 aa  52.8  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.42287  normal  0.0601314 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3179  O-antigen polymerase  29.1 
 
 		 453 aa  52.4  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.579286  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2327  O-antigen polymerase  23.39 
 
 		 475 aa  52  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4391  O-antigen polymerase  24.81 
 
 		 494 aa  52  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.6355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0083  membrane protein  24.05 
 
 		 443 aa  51.6  0.00003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.735968  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4227  O-antigen polymerase  24.52 
 
 		 457 aa  50.8  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4286  inorganic carbon transporter  24.52 
 
 		 457 aa  50.8  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.816665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0069  O-antigen polymerase  24.63 
 
 		 443 aa  50.4  0.00006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1072  hypothetical protein  27.05 
 
 		 457 aa  50.4  0.00007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.285493  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3695  hypothetical protein  23.21 
 
 		 404 aa  50.1  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2338  O-antigen polymerase  24.49 
 
 		 425 aa  50.4  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2737  O-antigen polymerase  28.66 
 
 		 542 aa  50.1  0.00009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24401  bicarbonate transporter, ICT family protein  23.78 
 
 		 436 aa  48.9  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1682  hypothetical protein  22.32 
 
 		 404 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3078  O-antigen polymerase  28.28 
 
 		 500 aa  48.5  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0508  O-antigen polymerase  27.21 
 
 		 440 aa  48.5  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1242  hypothetical protein  26.15 
 
 		 427 aa  48.1  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.684679  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1650  hypothetical protein  22.82 
 
 		 404 aa  48.1  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.192586  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18850  O-antigen polymerase  28.16 
 
 		 393 aa  47.8  0.0005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1468  secreted polysaccharide polymerase  22.82 
 
 		 404 aa  47.4  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00102355  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1496  hypothetical protein  22.33 
 
 		 404 aa  47.4  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.285071  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1614  hypothetical protein  22.33 
 
 		 404 aa  47.4  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.363158  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02624  membrane protein  26.96 
 
 		 431 aa  47  0.0008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0466  O-antigen polymerase  26.42 
 
 		 589 aa  47  0.0008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.285163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0024  O-antigen polymerase  25.1 
 
 		 456 aa  47  0.0009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2813  O-antigen polymerase  22.01 
 
 		 773 aa  46.2  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.192356  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0364  O-antigen polymerase  23.66 
 
 		 428 aa  46.6  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3684  O-antigen polymerase  28.36 
 
 		 424 aa  46.6  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0534  O-antigen polymerase  26.91 
 
 		 607 aa  45.8  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.462274  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4235  O-antigen polymerase  25 
 
 		 474 aa  45.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000407687  unclonable  0.0000107528 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1940  O-antigen polymerase  40.62 
 
 		 453 aa  45.8  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5250  O-antigen polymerase  24.74 
 
 		 336 aa  45.8  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0654  O-antigen polymerase  27.44 
 
 		 480 aa  45.8  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00317709 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1691  O-antigen polymerase  26.59 
 
 		 512 aa  45.4  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.121195  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2459  O-antigen polymerase  23.16 
 
 		 437 aa  45.8  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1309  conserved hypothetical conserved membrane protein  28.91 
 
 		 414 aa  45.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3077  O-antigen polymerase  26.17 
 
 		 504 aa  45.4  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1221  conserved hypothetical conserved membrane protein  26.42 
 
 		 410 aa  45.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1954  hypothetical protein  26.79 
 
 		 443 aa  44.7  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2638  O-antigen polymerase  25.9 
 
 		 428 aa  45.4  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1241  hypothetical protein  20.08 
 
 		 396 aa  45.1  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0582  O-antigen polymerase  27.78 
 
 		 454 aa  44.7  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.814347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2018  O-antigen polymerase  27.37 
 
 		 523 aa  44.7  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000808268  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1822  O-antigen polymerase  23.02 
 
 		 461 aa  44.3  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.831736  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1869  O-antigen polymerase  28.12 
 
 		 459 aa  44.3  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2933  O-antigen polymerase  22.76 
 
 		 458 aa  44.3  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000205816  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0677  O-antigen polymerase  29.19 
 
 		 436 aa  44.3  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.857845  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1087  O-antigen polymerase  23.32 
 
 		 612 aa  43.9  0.006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4110  O-antigen polymerase  28.57 
 
 		 930 aa  43.9  0.007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3580  O-antigen polymerase  26.09 
 
 		 504 aa  43.5  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2608  O-antigen polymerase  25.63 
 
 		 432 aa  43.5  0.01  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.212106  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>