11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3537 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3537  membrane protein PslJ  100 
 
 		 471 aa  924    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0975897  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3309  hypothetical protein  83.86 
 
 		 471 aa  727    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.110006  normal  0.406179 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4279  hypothetical protein  58.86 
 
 		 480 aa  450  1e-125  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.95109  hitchhiker  0.00017763 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35630  hypothetical protein  53.08 
 
 		 478 aa  427  1e-118  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.173114  hitchhiker  0.0000000277726 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3001  hypothetical protein  56.5 
 
 		 478 aa  422  1e-117  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.407435  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0654  O-antigen polymerase  30.96 
 
 		 480 aa  67.8  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00317709 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1569  O-antigen polymerase  28.91 
 
 		 489 aa  48.5  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.497135 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4864  inorganic carbon transporter  29.7 
 
 		 467 aa  48.5  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.867776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1362  O-antigen polymerase  27.41 
 
 		 425 aa  45.4  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.185241  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0733  O-antigen polymerase  24.86 
 
 		 485 aa  45.1  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.480414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3268  wzy family polymerase, exosortase system type 1 associated  29.89 
 
 		 452 aa  44.7  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.869746  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>