14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_3309 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3537  membrane protein PslJ  83.86 
 
 		 471 aa  761    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0975897  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3309  hypothetical protein  100 
 
 		 471 aa  918    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.110006  normal  0.406179 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4279  hypothetical protein  59.65 
 
 		 480 aa  442  1e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.95109  hitchhiker  0.00017763 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35630  hypothetical protein  52.64 
 
 		 478 aa  420  1e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.173114  hitchhiker  0.0000000277726 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3001  hypothetical protein  55.76 
 
 		 478 aa  412  1e-114  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.407435  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0654  O-antigen polymerase  28.09 
 
 		 480 aa  63.9  0.000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00317709 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4864  inorganic carbon transporter  28.71 
 
 		 467 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.867776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1362  O-antigen polymerase  27.84 
 
 		 425 aa  47.4  0.0006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.185241  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3696  O-antigen polymerase  29.49 
 
 		 461 aa  45.8  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.312837 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1869  O-antigen polymerase  26.42 
 
 		 459 aa  45.1  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4391  O-antigen polymerase  25 
 
 		 494 aa  44.3  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.6355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1654  O-antigen polymerase  26.56 
 
 		 754 aa  43.5  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2384  O-antigen polymerase  24.91 
 
 		 436 aa  43.5  0.008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.486663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2975  O-antigen polymerase  28.27 
 
 		 549 aa  43.5  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.024758  decreased coverage  0.00000748304 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>