23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4391 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4391  O-antigen polymerase  100 
 
 		 494 aa  962    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.6355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0733  O-antigen polymerase  87.16 
 
 		 485 aa  727    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.480414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0654  O-antigen polymerase  55.67 
 
 		 480 aa  466  9.999999999999999e-131  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00317709 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4465  O-antigen polymerase  47.59 
 
 		 479 aa  351  2e-95  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000989096  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0103  O-antigen polymerase  24.73 
 
 		 492 aa  60.8  0.00000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3537  membrane protein PslJ  24.18 
 
 		 471 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0975897  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3103  O-antigen polymerase  29.29 
 
 		 498 aa  55.8  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.313581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3309  hypothetical protein  27.39 
 
 		 471 aa  54.3  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.110006  normal  0.406179 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4116  O-antigen polymerase  21.72 
 
 		 540 aa  52.4  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0014553  hitchhiker  0.00000561153 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4957  O-antigen polymerase  21.9 
 
 		 470 aa  51.6  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4864  inorganic carbon transporter  27.27 
 
 		 467 aa  50.4  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.867776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0314  O-antigen polymerase  27 
 
 		 397 aa  50.1  0.00009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3078  O-antigen polymerase  30 
 
 		 500 aa  50.1  0.00009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3696  O-antigen polymerase  22.67 
 
 		 461 aa  50.1  0.00009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.312837 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0301  O-antigen polymerase  27.73 
 
 		 464 aa  47.4  0.0005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35630  hypothetical protein  30.65 
 
 		 478 aa  47.4  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.173114  hitchhiker  0.0000000277726 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3001  hypothetical protein  30.65 
 
 		 478 aa  47.4  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.407435  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2933  O-antigen polymerase  23.75 
 
 		 458 aa  46.2  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000205816  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4268  O-antigen polymerase  26.17 
 
 		 503 aa  45.8  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.209068 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2375  O-antigen polymerase  25.61 
 
 		 500 aa  45.8  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4279  hypothetical protein  30.28 
 
 		 480 aa  45.1  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.95109  hitchhiker  0.00017763 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4494  hypothetical protein  24.75 
 
 		 447 aa  43.9  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00401546  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0845  hypothetical protein  25 
 
 		 537 aa  43.5  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.149779  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>