10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_4279 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_4279  hypothetical protein  100 
 
 		 480 aa  917    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.95109  hitchhiker  0.00017763 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3537  membrane protein PslJ  57.82 
 
 		 471 aa  498  1e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0975897  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3309  hypothetical protein  58.03 
 
 		 471 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.110006  normal  0.406179 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35630  hypothetical protein  59.82 
 
 		 478 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.173114  hitchhiker  0.0000000277726 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3001  hypothetical protein  61.94 
 
 		 478 aa  449  1e-125  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.407435  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0654  O-antigen polymerase  29.85 
 
 		 480 aa  82.4  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00317709 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4391  O-antigen polymerase  30.28 
 
 		 494 aa  50.4  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.6355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1569  O-antigen polymerase  35.94 
 
 		 489 aa  49.7  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.497135 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0733  O-antigen polymerase  26.35 
 
 		 485 aa  48.1  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.480414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4864  inorganic carbon transporter  31.03 
 
 		 467 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.867776  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>