11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_3001 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_35630  hypothetical protein  98.95 
 
 
478 aa  920    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.173114  hitchhiker  0.0000000277726 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3001  hypothetical protein  100 
 
 
478 aa  928    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.407435  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3537  membrane protein PslJ  54.65 
 
 
471 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0975897  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4279  hypothetical protein  60.04 
 
 
480 aa  434  1e-120  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.95109  hitchhiker  0.00017763 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3309  hypothetical protein  56.14 
 
 
471 aa  426  1e-118  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.110006  normal  0.406179 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1869  O-antigen polymerase  27.27 
 
 
459 aa  55.8  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1569  O-antigen polymerase  28.57 
 
 
489 aa  53.9  0.000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.497135 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4864  inorganic carbon transporter  33.5 
 
 
467 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.867776  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0654  O-antigen polymerase  23.02 
 
 
480 aa  46.2  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00317709 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2384  O-antigen polymerase  24.81 
 
 
436 aa  44.3  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.486663  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0677  O-antigen polymerase  26.89 
 
 
436 aa  43.5  0.008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.857845  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>