59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_1869 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013525  Tter_1869  O-antigen polymerase  100 
 
 
459 aa  889    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2722  O-antigen polymerase  34.3 
 
 
497 aa  85.1  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.616494  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2384  O-antigen polymerase  28.02 
 
 
436 aa  72.8  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.486663  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4227  O-antigen polymerase  25.83 
 
 
457 aa  72.8  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3256  O-antigen polymerase  29.89 
 
 
1025 aa  72.4  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.711295  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4286  inorganic carbon transporter  25.83 
 
 
457 aa  72.4  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.816665  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4864  inorganic carbon transporter  24.92 
 
 
467 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.867776  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3696  O-antigen polymerase  24.8 
 
 
461 aa  70.1  0.00000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.312837 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4957  O-antigen polymerase  24.91 
 
 
470 aa  67.8  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1087  O-antigen polymerase  24.04 
 
 
612 aa  67.4  0.0000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0065  O-antigen polymerase  29.29 
 
 
502 aa  65.9  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.321315  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4116  O-antigen polymerase  27.69 
 
 
540 aa  64.7  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0014553  hitchhiker  0.00000561153 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2653  O-antigen polymerase  30 
 
 
499 aa  64.3  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2455  O-antigen polymerase  28.51 
 
 
435 aa  61.2  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0818595  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2638  O-antigen polymerase  23.35 
 
 
428 aa  60.5  0.00000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1822  O-antigen polymerase  23.59 
 
 
461 aa  59.3  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.831736  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0466  O-antigen polymerase  30.26 
 
 
589 aa  59.3  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.285163  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2327  O-antigen polymerase  22.85 
 
 
475 aa  56.2  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0103  O-antigen polymerase  27.35 
 
 
492 aa  55.8  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003538  putative membrane protein of ExoQ family involved in exopolysaccharide production  31.25 
 
 
454 aa  55.5  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24401  bicarbonate transporter, ICT family protein  28.17 
 
 
436 aa  55.8  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0822  inorganic carbon transporter  22.01 
 
 
471 aa  54.7  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.999427  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5004  O-antigen polymerase family protein  29.65 
 
 
436 aa  54.7  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02223  hypothetical protein  28.25 
 
 
461 aa  53.5  0.000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2378  O-antigen polymerase  32.31 
 
 
700 aa  52.4  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.868657  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3018  O-antigen polymerase  25.97 
 
 
446 aa  52.4  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2212  O-antigen polymerase  24.83 
 
 
415 aa  51.6  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0880149  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2065  bicarbonate transporter  25.37 
 
 
438 aa  51.2  0.00004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2401  O-antigen polymerase  28.86 
 
 
426 aa  51.2  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0523174  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2813  O-antigen polymerase  26.24 
 
 
773 aa  50.4  0.00006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.192356  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0301  O-antigen polymerase  28.65 
 
 
464 aa  50.1  0.00007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2006  O-antigen polymerase  31.54 
 
 
426 aa  50.1  0.00007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.188841  normal  0.439827 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0357  inorganic carbon transporter  27.37 
 
 
467 aa  50.1  0.00008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.152421  normal  0.510876 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3537  membrane protein PslJ  27.41 
 
 
471 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0975897  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3726  O-antigen polymerase  26.71 
 
 
438 aa  49.7  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.114038 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2009  O-antigen polymerase  20.73 
 
 
459 aa  49.3  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0279  bicarbonate transporter  27.64 
 
 
438 aa  48.9  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0534  O-antigen polymerase  29.37 
 
 
607 aa  48.5  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.462274  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1940  O-antigen polymerase  38.54 
 
 
453 aa  48.9  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3526  O-antigen polymerase  31.9 
 
 
668 aa  48.5  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000131402  normal  0.176407 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1650  hypothetical protein  26.28 
 
 
404 aa  48.5  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.192586  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3309  hypothetical protein  28.57 
 
 
471 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.110006  normal  0.406179 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2694  O-antigen polymerase  22.42 
 
 
532 aa  48.1  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00327343  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0559  hypothetical protein  33.09 
 
 
569 aa  47.8  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.261302  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0464  O-antigen polymerase  26.11 
 
 
590 aa  47.8  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.325512  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1614  hypothetical protein  26.75 
 
 
404 aa  47.4  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.363158  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1468  secreted polysaccharide polymerase  26.75 
 
 
404 aa  47.4  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00102355  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1496  hypothetical protein  26.75 
 
 
404 aa  47.4  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.285071  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3695  hypothetical protein  26.75 
 
 
404 aa  47  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1682  hypothetical protein  26.75 
 
 
404 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0714  O-antigen polymerase  21.77 
 
 
781 aa  45.8  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1241  hypothetical protein  28.04 
 
 
396 aa  45.4  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0479  O-antigen polymerase  28.5 
 
 
578 aa  45.4  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.575245  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35630  hypothetical protein  27.65 
 
 
478 aa  45.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.173114  hitchhiker  0.0000000277726 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3885  O-antigen polymerase  32.03 
 
 
443 aa  45.8  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.722344  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4434  O-antigen polymerase  22.25 
 
 
474 aa  44.7  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3326  O-antigen polymerase  28.16 
 
 
502 aa  44.3  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0650  O-antigen polymerase family protein  25.55 
 
 
595 aa  43.9  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0249  O-antigen polymerase  29.58 
 
 
492 aa  43.5  0.007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>