28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3179 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_3179  O-antigen polymerase  100 
 
 		 453 aa  914    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.579286  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0227  hypothetical protein  60 
 
 		 460 aa  519  1e-146  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.604472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4820  O-antigen polymerase  50.79 
 
 		 487 aa  452  1.0000000000000001e-126  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.53889  normal  0.786094 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0297  hypothetical protein  27.79 
 
 		 428 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.515931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0677  O-antigen polymerase  28.57 
 
 		 436 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.857845  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3268  wzy family polymerase, exosortase system type 1 associated  25.17 
 
 		 452 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.869746  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2530  wzy family polymerase, exosortase system type 1 associated  25.64 
 
 		 463 aa  124  5e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.42287  normal  0.0601314 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2960  O-antigen polymerase  26.17 
 
 		 436 aa  120  3.9999999999999996e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.12688  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1955  O-antigen polymerase  26.81 
 
 		 468 aa  120  4.9999999999999996e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.324728  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3094  O-antigen polymerase  26.82 
 
 		 444 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0300  O-antigen polymerase  23.83 
 
 		 446 aa  105  1e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0582  O-antigen polymerase  24.55 
 
 		 454 aa  105  1e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.814347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2412  hypothetical protein  25.53 
 
 		 444 aa  101  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0119  O-antigen polymerase  22.91 
 
 		 466 aa  101  3e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1184  O-antigen polymerase  23.92 
 
 		 412 aa  67.4  0.0000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1558  O-antigen polymerase  22.67 
 
 		 472 aa  57  0.0000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.238347  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2459  O-antigen polymerase  25.93 
 
 		 437 aa  55.5  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3103  O-antigen polymerase  29.23 
 
 		 498 aa  55.5  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.313581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2375  O-antigen polymerase  29.83 
 
 		 500 aa  53.9  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01295  secreted polysaccharide polymerase  26.23 
 
 		 385 aa  50.8  0.00005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2363  hypothetical protein  25.26 
 
 		 431 aa  50.1  0.00008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0364  O-antigen polymerase  23.89 
 
 		 428 aa  49.3  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0152  hypothetical protein  22.44 
 
 		 389 aa  48.5  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3579  O-antigen polymerase  22.57 
 
 		 501 aa  46.2  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3077  O-antigen polymerase  27.01 
 
 		 504 aa  45.8  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04059  O-Antigen Polymerase family  25.82 
 
 		 425 aa  44.3  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3401  polysaccharide deacetylase  29.9 
 
 		 464 aa  43.9  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.264275  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1954  hypothetical protein  24.74 
 
 		 443 aa  43.9  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>