40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1184 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1184  O-antigen polymerase  100 
 
 		 412 aa  832    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2530  wzy family polymerase, exosortase system type 1 associated  24.69 
 
 		 463 aa  70.1  0.00000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.42287  normal  0.0601314 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0297  hypothetical protein  22.74 
 
 		 428 aa  69.3  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.515931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02223  hypothetical protein  26.61 
 
 		 461 aa  68.2  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003538  putative membrane protein of ExoQ family involved in exopolysaccharide production  26.12 
 
 		 454 aa  60.1  0.00000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2459  O-antigen polymerase  26.34 
 
 		 437 aa  59.3  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0301  O-antigen polymerase  26.41 
 
 		 464 aa  59.7  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3179  O-antigen polymerase  23.92 
 
 		 453 aa  58.5  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.579286  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3696  O-antigen polymerase  26.74 
 
 		 461 aa  58.5  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.312837 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0677  O-antigen polymerase  23.89 
 
 		 436 aa  58.2  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.857845  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2338  O-antigen polymerase  27.15 
 
 		 425 aa  57.8  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0582  O-antigen polymerase  24.3 
 
 		 454 aa  57.4  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.814347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2212  O-antigen polymerase  27.59 
 
 		 415 aa  55.5  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0880149  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2018  O-antigen polymerase  26.55 
 
 		 456 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01295  secreted polysaccharide polymerase  27.62 
 
 		 385 aa  55.5  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0227  hypothetical protein  22.6 
 
 		 460 aa  55.5  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.604472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4235  O-antigen polymerase  30.61 
 
 		 474 aa  54.3  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000407687  unclonable  0.0000107528 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1558  O-antigen polymerase  24.15 
 
 		 472 aa  53.1  0.000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.238347  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1954  hypothetical protein  25.11 
 
 		 443 aa  51.2  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1955  O-antigen polymerase  23.03 
 
 		 468 aa  50.8  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.324728  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0119  O-antigen polymerase  23.57 
 
 		 466 aa  50.8  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3695  hypothetical protein  26.37 
 
 		 404 aa  50.1  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0152  hypothetical protein  25 
 
 		 389 aa  50.1  0.00008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4820  O-antigen polymerase  26.71 
 
 		 487 aa  49.7  0.00009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.53889  normal  0.786094 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3103  O-antigen polymerase  25.54 
 
 		 498 aa  47.8  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.313581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3094  O-antigen polymerase  25.76 
 
 		 444 aa  47.8  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2638  O-antigen polymerase  25.56 
 
 		 428 aa  47.4  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2327  O-antigen polymerase  23.53 
 
 		 475 aa  47  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1650  hypothetical protein  26.73 
 
 		 404 aa  47  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.192586  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4227  O-antigen polymerase  27.98 
 
 		 457 aa  47  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1682  hypothetical protein  28 
 
 		 404 aa  46.6  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2960  O-antigen polymerase  22.62 
 
 		 436 aa  46.6  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.12688  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4286  inorganic carbon transporter  27.98 
 
 		 457 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.816665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1639  hypothetical protein  26.44 
 
 		 447 aa  45.4  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1496  hypothetical protein  27.43 
 
 		 404 aa  43.9  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.285071  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1468  secreted polysaccharide polymerase  27.43 
 
 		 404 aa  43.9  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00102355  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2009  O-antigen polymerase  24.89 
 
 		 459 aa  43.9  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1614  hypothetical protein  27.43 
 
 		 404 aa  43.9  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.363158  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0300  O-antigen polymerase  21.14 
 
 		 446 aa  43.9  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2813  O-antigen polymerase  30.77 
 
 		 773 aa  43.1  0.008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.192356  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>