54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1955 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_1955  O-antigen polymerase  100 
 
 
468 aa  941    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.324728  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2530  wzy family polymerase, exosortase system type 1 associated  41.11 
 
 
463 aa  325  1e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.42287  normal  0.0601314 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0297  hypothetical protein  38.94 
 
 
428 aa  316  5e-85  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.515931  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3268  wzy family polymerase, exosortase system type 1 associated  38.49 
 
 
452 aa  291  2e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.869746  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0300  O-antigen polymerase  36.48 
 
 
446 aa  288  2e-76  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0119  O-antigen polymerase  37.95 
 
 
466 aa  286  5e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0677  O-antigen polymerase  37.39 
 
 
436 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.857845  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2412  hypothetical protein  38.9 
 
 
444 aa  267  2.9999999999999995e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1558  O-antigen polymerase  39.73 
 
 
472 aa  261  2e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.238347  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3094  O-antigen polymerase  39.69 
 
 
444 aa  254  3e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0582  O-antigen polymerase  37.3 
 
 
454 aa  224  2e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.814347  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2960  O-antigen polymerase  28.54 
 
 
436 aa  182  2e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.12688  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4820  O-antigen polymerase  27.19 
 
 
487 aa  125  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.53889  normal  0.786094 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0227  hypothetical protein  26.12 
 
 
460 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.604472  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3179  O-antigen polymerase  26.81 
 
 
453 aa  103  5e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.579286  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2455  O-antigen polymerase  24.4 
 
 
435 aa  88.6  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0818595  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02223  hypothetical protein  25.47 
 
 
461 aa  85.9  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3579  O-antigen polymerase  23.85 
 
 
501 aa  77  0.0000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0152  hypothetical protein  26.8 
 
 
389 aa  76.3  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0301  O-antigen polymerase  25.42 
 
 
464 aa  74.7  0.000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003538  putative membrane protein of ExoQ family involved in exopolysaccharide production  25.41 
 
 
454 aa  71.6  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2459  O-antigen polymerase  26.16 
 
 
437 aa  70.5  0.00000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2363  hypothetical protein  23.66 
 
 
431 aa  65.5  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2338  O-antigen polymerase  25.78 
 
 
425 aa  65.1  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0822  inorganic carbon transporter  29.47 
 
 
471 aa  60.8  0.00000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.999427  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4116  O-antigen polymerase  26.01 
 
 
540 aa  60.8  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0014553  hitchhiker  0.00000561153 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2375  O-antigen polymerase  31.16 
 
 
500 aa  59.7  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1497  O-antigen polymerase  26.85 
 
 
672 aa  57.8  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3103  O-antigen polymerase  28.63 
 
 
498 aa  55.8  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.313581  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2608  O-antigen polymerase  25.3 
 
 
432 aa  54.3  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.212106  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5249  O-antigen polymerase  26.32 
 
 
671 aa  53.9  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.566036  normal  0.80633 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3696  O-antigen polymerase  23.2 
 
 
461 aa  53.5  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.312837 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01295  secreted polysaccharide polymerase  26.26 
 
 
385 aa  53.1  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4864  inorganic carbon transporter  32.66 
 
 
467 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.867776  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0287  O-antigen polymerase  25.6 
 
 
415 aa  52.4  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.509541  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2821  O-antigen polymerase  28.82 
 
 
434 aa  49.7  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1639  hypothetical protein  25.32 
 
 
447 aa  48.5  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3401  polysaccharide deacetylase  25.81 
 
 
464 aa  47.4  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.264275  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1927  O-antigen polymerase  25.71 
 
 
679 aa  47.4  0.0005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2327  O-antigen polymerase  27.65 
 
 
475 aa  47  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2640  O-antigen polymerase  29.19 
 
 
434 aa  47  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0149794  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4227  O-antigen polymerase  28.8 
 
 
457 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3077  O-antigen polymerase  27.21 
 
 
504 aa  46.2  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2333  O-antigen polymerase  28.89 
 
 
431 aa  46.2  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.964533  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4286  inorganic carbon transporter  28.8 
 
 
457 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.816665  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1788  O-antigen polymerase  22.55 
 
 
446 aa  46.6  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2009  O-antigen polymerase  20.75 
 
 
459 aa  45.4  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18850  O-antigen polymerase  28.07 
 
 
393 aa  45.1  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2808  O-antigen polymerase  28.28 
 
 
494 aa  44.7  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2384  O-antigen polymerase  27.8 
 
 
436 aa  44.7  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.486663  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2403  O-antigen polymerase  25 
 
 
509 aa  43.9  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.166063  normal  0.151725 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2212  O-antigen polymerase  25 
 
 
415 aa  43.5  0.008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0880149  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0142  O-antigen polymerase  26.95 
 
 
496 aa  43.5  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3526  O-antigen polymerase  24.51 
 
 
668 aa  43.1  0.01  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000131402  normal  0.176407 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>