27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1954 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1954  hypothetical protein  100 
 
 		 443 aa  901    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0845  hypothetical protein  26.67 
 
 		 537 aa  93.6  7e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.149779  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2694  O-antigen polymerase  23.29 
 
 		 532 aa  65.9  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00327343  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1639  hypothetical protein  25.45 
 
 		 447 aa  65.1  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18850  O-antigen polymerase  30.52 
 
 		 393 aa  60.8  0.00000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0297  hypothetical protein  24.43 
 
 		 428 aa  58.2  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.515931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0714  O-antigen polymerase  31.36 
 
 		 781 aa  56.2  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2212  O-antigen polymerase  24.54 
 
 		 415 aa  55.5  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0880149  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0582  O-antigen polymerase  23.75 
 
 		 454 aa  55.1  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.814347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2455  O-antigen polymerase  28.65 
 
 		 435 aa  54.7  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0818595  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3078  O-antigen polymerase  27.13 
 
 		 500 aa  53.9  0.000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2338  O-antigen polymerase  23.65 
 
 		 425 aa  53.1  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1184  O-antigen polymerase  25.11 
 
 		 412 aa  50.8  0.00005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0654  O-antigen polymerase  27.48 
 
 		 480 aa  50.4  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00317709 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0152  hypothetical protein  27.35 
 
 		 389 aa  50.4  0.00007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3103  O-antigen polymerase  27.88 
 
 		 498 aa  48.5  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.313581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1511  O-antigen polymerase  24.88 
 
 		 436 aa  48.1  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.995807  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0583  O-antigen polymerase  26.98 
 
 		 449 aa  47.4  0.0006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2251  O-antigen polymerase  27.07 
 
 		 561 aa  46.2  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.220671  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2459  O-antigen polymerase  25 
 
 		 437 aa  46.6  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4227  O-antigen polymerase  24 
 
 		 457 aa  45.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3247  O-antigen polymerase  33.04 
 
 		 452 aa  44.3  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0368  O-antigen polymerase  27.32 
 
 		 579 aa  44.3  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4286  inorganic carbon transporter  24 
 
 		 457 aa  44.3  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.816665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3018  O-antigen polymerase  22.15 
 
 		 446 aa  43.9  0.006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3179  O-antigen polymerase  24.74 
 
 		 453 aa  43.1  0.009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.579286  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2530  wzy family polymerase, exosortase system type 1 associated  26.35 
 
 		 463 aa  43.1  0.01  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.42287  normal  0.0601314 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>