14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0583 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_0583  O-antigen polymerase  100 
 
 
449 aa  868    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2638  O-antigen polymerase  25.44 
 
 
428 aa  53.9  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4116  O-antigen polymerase  26.73 
 
 
540 aa  51.6  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0014553  hitchhiker  0.00000561153 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2813  O-antigen polymerase  34.1 
 
 
773 aa  51.2  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.192356  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4286  inorganic carbon transporter  30.77 
 
 
457 aa  50.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.816665  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1394  O-antigen polymerase  31.68 
 
 
399 aa  49.7  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0739482 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4227  O-antigen polymerase  29.67 
 
 
457 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1954  hypothetical protein  26.98 
 
 
443 aa  47.4  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0127  hypothetical protein  29.29 
 
 
845 aa  45.8  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2212  O-antigen polymerase  27.84 
 
 
415 aa  45.4  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0880149  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2327  O-antigen polymerase  29.29 
 
 
475 aa  45.1  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1888  hypothetical protein  27.68 
 
 
415 aa  43.9  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2384  O-antigen polymerase  25 
 
 
436 aa  44.3  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.486663  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5250  O-antigen polymerase  26.32 
 
 
336 aa  44.3  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>