45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1511 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_1511  O-antigen polymerase  100 
 
 		 436 aa  862    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.995807  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2006  O-antigen polymerase  23.27 
 
 		 426 aa  69.7  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.188841  normal  0.439827 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2617  hypothetical protein  25.57 
 
 		 399 aa  68.6  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0206  O-antigen polymerase  28.41 
 
 		 444 aa  67.4  0.0000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0160  O-antigen ligase WaaL  26.01 
 
 		 408 aa  65.5  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0263  O-antigen ligase WaaL  26.01 
 
 		 408 aa  65.5  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0319  O-antigen polymerase  30.6 
 
 		 422 aa  64.7  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2401  O-antigen polymerase  21.61 
 
 		 426 aa  64.7  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0523174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0184  O-antigen polymerase  32.11 
 
 		 435 aa  63.9  0.000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.146439  normal  0.684402 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0759  O-antigen polymerase  24.63 
 
 		 430 aa  63.2  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.402812  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2204  hypothetical protein  28.12 
 
 		 435 aa  61.6  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.556953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2712  O-antigen polymerase  28.16 
 
 		 413 aa  60.8  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0646679  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04059  O-Antigen Polymerase family  21.79 
 
 		 425 aa  58.9  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2478  O-antigen polymerase  24.12 
 
 		 415 aa  57  0.0000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1650  hypothetical protein  28.51 
 
 		 404 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.192586  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3695  hypothetical protein  28.51 
 
 		 404 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1614  hypothetical protein  28.27 
 
 		 404 aa  51.6  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.363158  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1468  secreted polysaccharide polymerase  28.27 
 
 		 404 aa  52  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00102355  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1496  hypothetical protein  28.27 
 
 		 404 aa  51.6  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.285071  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1682  hypothetical protein  28.27 
 
 		 404 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2813  O-antigen polymerase  24.42 
 
 		 773 aa  51.6  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.192356  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0969  O-antigen polymerase  27.4 
 
 		 446 aa  51.2  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.948168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0474  O-antigen polymerase  33.33 
 
 		 595 aa  49.7  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18850  O-antigen polymerase  24.91 
 
 		 393 aa  49.3  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0364  O-antigen polymerase  27.64 
 
 		 428 aa  48.9  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0418  O-antigen polymerase  31.29 
 
 		 431 aa  48.5  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1954  hypothetical protein  24.88 
 
 		 443 aa  48.1  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0333  O-antigen polymerase  23.43 
 
 		 416 aa  47.8  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0657  O-antigen polymerase  35.48 
 
 		 588 aa  47.4  0.0005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0056678  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0861  O-antigen polymerase  26.75 
 
 		 409 aa  47.4  0.0005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3774  O-antigen polymerase  25.1 
 
 		 439 aa  47.4  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2338  O-antigen polymerase  26.16 
 
 		 425 aa  47  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0780  O-antigen polymerase  24.4 
 
 		 415 aa  46.2  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.292399  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2523  O-antigen polymerase  22.65 
 
 		 738 aa  45.4  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0830151  hitchhiker  0.00448531 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1429  O-antigen polymerase  30.58 
 
 		 405 aa  45.4  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3113  O-antigen polymerase  24.76 
 
 		 467 aa  45.4  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000265772  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0069  O-antigen polymerase  23.56 
 
 		 443 aa  45.4  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0980  hypothetical protein  26.76 
 
 		 409 aa  45.1  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0267  O-antigen polymerase  24.15 
 
 		 430 aa  45.1  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0678  hypothetical protein  28.57 
 
 		 594 aa  45.1  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.206131 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3061  O-antigen polymerase  25.77 
 
 		 465 aa  44.7  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.433121  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0152  hypothetical protein  28.78 
 
 		 389 aa  44.3  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0083  membrane protein  23.08 
 
 		 443 aa  43.5  0.007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.735968  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3288  O-antigen polymerase  24.21 
 
 		 594 aa  43.5  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.709506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3581  O-antigen polymerase  29.05 
 
 		 429 aa  43.1  0.009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.143797  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>