51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0368 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_0368  O-antigen polymerase  100 
 
 		 579 aa  1179    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2811  hypothetical protein  36 
 
 		 597 aa  343  5e-93  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03709  hypothetical protein  36.31 
 
 		 594 aa  340  2.9999999999999998e-92  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002359  lipid A core-O-antigen ligase  35.59 
 
 		 561 aa  328  2.0000000000000001e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0446  O-antigen polymerase  33.68 
 
 		 585 aa  296  5e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0423  O-antigen polymerase  28.57 
 
 		 557 aa  232  1e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.955955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4715  O-antigen polymerase  28.8 
 
 		 545 aa  154  5.9999999999999996e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.408363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4678  O-antigen polymerase  36.25 
 
 		 544 aa  77.8  0.0000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0479  O-antigen polymerase  27.62 
 
 		 578 aa  72.8  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.575245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2461  O-antigen polymerase  24.55 
 
 		 580 aa  71.2  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.913597  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0464  O-antigen polymerase  24.15 
 
 		 590 aa  59.3  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.325512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0410  O-antigen polymerase  26.97 
 
 		 552 aa  59.3  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0559  hypothetical protein  24.29 
 
 		 569 aa  56.2  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.261302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4780  O-antigen polymerase  25.81 
 
 		 594 aa  56.2  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.793749  normal  0.179192 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18850  O-antigen polymerase  26.73 
 
 		 393 aa  55.5  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3018  O-antigen polymerase  25.48 
 
 		 446 aa  55.1  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0466  O-antigen polymerase  24.63 
 
 		 589 aa  55.1  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.285163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5652  O-antigen polymerase  32.1 
 
 		 426 aa  53.9  0.000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0534  O-antigen polymerase  21.09 
 
 		 607 aa  51.2  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.462274  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1691  O-antigen polymerase  26.57 
 
 		 512 aa  51.2  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.121195  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2813  O-antigen polymerase  25.19 
 
 		 773 aa  51.2  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.192356  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2349  O-antigen polymerase  29.89 
 
 		 426 aa  49.7  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0392  O-antigen polymerase  26.19 
 
 		 398 aa  50.1  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000178586  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4673  O-antigen polymerase  23.24 
 
 		 560 aa  49.3  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5972  O-antigen polymerase  28.12 
 
 		 592 aa  49.7  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0743128 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04059  O-Antigen Polymerase family  25.78 
 
 		 425 aa  48.9  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2034  O-antigen polymerase  28.57 
 
 		 592 aa  48.5  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1698  O-antigen polymerase  27.59 
 
 		 426 aa  48.5  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2333  O-antigen polymerase  27.59 
 
 		 426 aa  48.5  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0425881 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2229  O-antigen polymerase  28.74 
 
 		 426 aa  48.9  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.541391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2310  O-antigen polymerase  27.59 
 
 		 426 aa  48.5  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2645  O-antigen polymerase  28.57 
 
 		 592 aa  48.5  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2674  O-antigen polymerase  28.57 
 
 		 592 aa  48.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1388  O-antigen polymerase  25.89 
 
 		 452 aa  47.4  0.0007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0474  O-antigen polymerase  21.89 
 
 		 595 aa  46.6  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1980  O-antigen polymerase  29.71 
 
 		 396 aa  46.6  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.638067 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0184  O-antigen polymerase  24.07 
 
 		 435 aa  45.8  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.146439  normal  0.684402 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0714  O-antigen polymerase  23.44 
 
 		 781 aa  46.2  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1087  O-antigen polymerase  25.2 
 
 		 612 aa  45.4  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003538  putative membrane protein of ExoQ family involved in exopolysaccharide production  29.38 
 
 		 454 aa  45.4  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1954  hypothetical protein  27.72 
 
 		 443 aa  45.4  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1186  Tetratricopeptide domain protein  23.79 
 
 		 829 aa  45.1  0.003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0301041  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2410  O-antigen polymerase  30.95 
 
 		 426 aa  44.7  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.231968 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2177  EXOQ family/lipid A core O-antigen ligase  25.61 
 
 		 495 aa  45.1  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.42634  normal  0.835874 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2478  O-antigen polymerase  30.67 
 
 		 415 aa  45.1  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4678  O-antigen polymerase  24.71 
 
 		 556 aa  45.1  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0142  O-antigen polymerase  26.36 
 
 		 496 aa  44.7  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1276  O-antigen polymerase  28.44 
 
 		 420 aa  44.7  0.005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000289141  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2896  O-antigen polymerase family protein  26.58 
 
 		 686 aa  43.9  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2516  O-antigen polymerase  26.58 
 
 		 686 aa  43.9  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.549504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0107  VanZ family protein  27.67 
 
 		 1122 aa  43.9  0.009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>