41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_2349 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008542  Bcen2424_2310  O-antigen polymerase  87.76 
 
 
426 aa  723    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2349  O-antigen polymerase  100 
 
 
426 aa  842    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1698  O-antigen polymerase  87.76 
 
 
426 aa  723    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5652  O-antigen polymerase  91.55 
 
 
426 aa  743    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2333  O-antigen polymerase  87.06 
 
 
426 aa  718    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0425881 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2229  O-antigen polymerase  98.59 
 
 
426 aa  833    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.541391  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2075  O-antigen polymerase  42.42 
 
 
432 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.123759  normal  0.0828112 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0338  O-antigen ligase  26.23 
 
 
436 aa  102  2e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0853  hypothetical protein  26.49 
 
 
416 aa  100  4e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1851  hypothetical protein  26.72 
 
 
429 aa  100  4e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2801  O-antigen polymerase  26.96 
 
 
434 aa  100  6e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1774  O-antigen polymerase  31.22 
 
 
418 aa  96.7  6e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00226394  normal  0.0339661 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0392  O-antigen polymerase  33.78 
 
 
398 aa  92.4  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000178586  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0884  hypothetical protein  26.49 
 
 
416 aa  92.4  1e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4092  O-antigen polymerase  27.72 
 
 
415 aa  91.3  3e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5667  putative O-antigen ligase  28.49 
 
 
427 aa  87.4  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304337  normal  0.482234 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2410  O-antigen polymerase  27.66 
 
 
426 aa  83.2  0.000000000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.231968 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2053  O-antigen polymerase  28.61 
 
 
405 aa  83.2  0.000000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7045  putative O-antigen polymerase  25.81 
 
 
448 aa  82  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3646  O-antigen polymerase  26.78 
 
 
410 aa  79.7  0.00000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0851  O-antigen polymerase domain-containing protein  26.78 
 
 
410 aa  79.7  0.00000000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.852584 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3515  O-antigen polymerase domain-containing protein  26.78 
 
 
410 aa  79.7  0.00000000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1980  O-antigen polymerase  27.49 
 
 
396 aa  72  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.638067 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1804  hypothetical protein  29.61 
 
 
410 aa  67  0.0000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0307014 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0232  O-antigen polymerase family protein  23.66 
 
 
417 aa  60.8  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0581783  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0408  O-antigen polymerase  23.66 
 
 
407 aa  60.8  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00264178 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1811  O-antigen polymerase  26.51 
 
 
417 aa  54.3  0.000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0319  O-antigen polymerase  28.57 
 
 
422 aa  51.2  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2478  O-antigen polymerase  31.65 
 
 
415 aa  51.2  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2006  O-antigen polymerase  29.05 
 
 
426 aa  50.8  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.188841  normal  0.439827 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2712  O-antigen polymerase  27.17 
 
 
413 aa  50.4  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0646679  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0368  O-antigen polymerase  29.89 
 
 
579 aa  50.4  0.00006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1429  O-antigen polymerase  27.05 
 
 
405 aa  47.8  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2204  hypothetical protein  33.57 
 
 
435 aa  47.8  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.556953  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2741  O-antigen polymerase  27.56 
 
 
333 aa  46.2  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.448774  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0418  O-antigen polymerase  24.76 
 
 
431 aa  45.4  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0508  O-antigen polymerase  28.07 
 
 
440 aa  44.7  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02935  hypothetical protein  28.17 
 
 
408 aa  45.1  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0850  hypothetical protein  28.5 
 
 
426 aa  44.3  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0783552 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0160  O-antigen ligase WaaL  30.21 
 
 
408 aa  43.5  0.008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0263  O-antigen ligase WaaL  30.21 
 
 
408 aa  43.5  0.008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>