43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_2229 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A5652  O-antigen polymerase  91.55 
 
 		 426 aa  741    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2229  O-antigen polymerase  100 
 
 		 426 aa  841    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.541391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2333  O-antigen polymerase  87.53 
 
 		 426 aa  718    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0425881 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1698  O-antigen polymerase  88.24 
 
 		 426 aa  723    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2349  O-antigen polymerase  98.59 
 
 		 426 aa  833    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2310  O-antigen polymerase  88.24 
 
 		 426 aa  723    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2075  O-antigen polymerase  42.42 
 
 		 432 aa  288  2e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.123759  normal  0.0828112 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0338  O-antigen ligase  26.72 
 
 		 436 aa  105  2e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1851  hypothetical protein  27.21 
 
 		 429 aa  104  4e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2801  O-antigen polymerase  27.98 
 
 		 434 aa  103  7e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0853  hypothetical protein  25.47 
 
 		 416 aa  99.4  1e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1774  O-antigen polymerase  31.7 
 
 		 418 aa  99  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00226394  normal  0.0339661 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4092  O-antigen polymerase  27.72 
 
 		 415 aa  92.8  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0884  hypothetical protein  25.47 
 
 		 416 aa  90.9  4e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0392  O-antigen polymerase  34.67 
 
 		 398 aa  90.9  4e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000178586  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5667  putative O-antigen ligase  28.49 
 
 		 427 aa  87.4  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304337  normal  0.482234 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2053  O-antigen polymerase  28.9 
 
 		 405 aa  84  0.000000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7045  putative O-antigen polymerase  25.93 
 
 		 448 aa  82.4  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3515  O-antigen polymerase domain-containing protein  27.32 
 
 		 410 aa  82.8  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3646  O-antigen polymerase  27.32 
 
 		 410 aa  82.8  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0851  O-antigen polymerase domain-containing protein  27.32 
 
 		 410 aa  82.8  0.00000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.852584 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2410  O-antigen polymerase  27.42 
 
 		 426 aa  82.4  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.231968 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1980  O-antigen polymerase  28.23 
 
 		 396 aa  73.6  0.000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.638067 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1804  hypothetical protein  30.1 
 
 		 410 aa  69.3  0.0000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0307014 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0408  O-antigen polymerase  23.47 
 
 		 407 aa  60.8  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00264178 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0232  O-antigen polymerase family protein  23.47 
 
 		 417 aa  60.5  0.00000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0581783  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2712  O-antigen polymerase  26.89 
 
 		 413 aa  53.1  0.000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0646679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1811  O-antigen polymerase  26.25 
 
 		 417 aa  53.1  0.000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2478  O-antigen polymerase  31.76 
 
 		 415 aa  52.4  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0319  O-antigen polymerase  28.57 
 
 		 422 aa  51.6  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2006  O-antigen polymerase  29.05 
 
 		 426 aa  51.2  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.188841  normal  0.439827 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0368  O-antigen polymerase  28.74 
 
 		 579 aa  49.3  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2204  hypothetical protein  34.41 
 
 		 435 aa  46.2  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.556953  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02935  hypothetical protein  28.17 
 
 		 408 aa  45.8  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1429  O-antigen polymerase  26.23 
 
 		 405 aa  46.2  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0160  O-antigen ligase WaaL  31.25 
 
 		 408 aa  44.7  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0263  O-antigen ligase WaaL  31.25 
 
 		 408 aa  44.7  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0418  O-antigen polymerase  25.08 
 
 		 431 aa  45.1  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2741  O-antigen polymerase  27.2 
 
 		 333 aa  44.7  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.448774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0850  hypothetical protein  28.5 
 
 		 426 aa  44.3  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0783552 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0508  O-antigen polymerase  27.19 
 
 		 440 aa  43.9  0.006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2401  O-antigen polymerase  25.52 
 
 		 426 aa  43.1  0.009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0523174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2750  O-antigen polymerase  27.91 
 
 		 489 aa  43.1  0.009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.205692 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>