49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp0884 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006368  lpp0884  hypothetical protein  100 
 
 		 416 aa  845    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0853  hypothetical protein  96.63 
 
 		 416 aa  777    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2333  O-antigen polymerase  25.52 
 
 		 426 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0425881 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2310  O-antigen polymerase  26.29 
 
 		 426 aa  113  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1698  O-antigen polymerase  26.29 
 
 		 426 aa  113  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0338  O-antigen ligase  26.78 
 
 		 436 aa  111  3e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1851  hypothetical protein  26.78 
 
 		 429 aa  109  8.000000000000001e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5652  O-antigen polymerase  27.66 
 
 		 426 aa  107  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2075  O-antigen polymerase  24.41 
 
 		 432 aa  93.6  5e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.123759  normal  0.0828112 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2349  O-antigen polymerase  24.68 
 
 		 426 aa  94  5e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2229  O-antigen polymerase  24.68 
 
 		 426 aa  92.8  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.541391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3646  O-antigen polymerase  28.62 
 
 		 410 aa  89.4  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0851  O-antigen polymerase domain-containing protein  28.62 
 
 		 410 aa  89.4  1e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.852584 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3515  O-antigen polymerase domain-containing protein  28.62 
 
 		 410 aa  89.4  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1804  hypothetical protein  24.56 
 
 		 410 aa  89  2e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0307014 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1811  O-antigen polymerase  32.91 
 
 		 417 aa  86.7  6e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4092  O-antigen polymerase  27.11 
 
 		 415 aa  87  6e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1774  O-antigen polymerase  26.2 
 
 		 418 aa  79.3  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00226394  normal  0.0339661 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0392  O-antigen polymerase  28.17 
 
 		 398 aa  73.6  0.000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000178586  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0232  O-antigen polymerase family protein  28.64 
 
 		 417 aa  71.6  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0581783  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0408  O-antigen polymerase  28.64 
 
 		 407 aa  71.2  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00264178 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5667  putative O-antigen ligase  25 
 
 		 427 aa  67.8  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304337  normal  0.482234 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1699  O-antigen polymerase  24.37 
 
 		 401 aa  67  0.0000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0418  O-antigen polymerase  26.27 
 
 		 431 aa  58.2  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2801  O-antigen polymerase  19.64 
 
 		 434 aa  57.4  0.0000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1429  O-antigen polymerase  27.37 
 
 		 405 aa  57  0.0000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2006  O-antigen polymerase  23.2 
 
 		 426 aa  54.7  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.188841  normal  0.439827 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2401  O-antigen polymerase  27.34 
 
 		 426 aa  53.1  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0523174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2617  hypothetical protein  23.08 
 
 		 399 aa  50.8  0.00004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2712  O-antigen polymerase  27.43 
 
 		 413 aa  50.8  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0646679  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04059  O-Antigen Polymerase family  23.84 
 
 		 425 aa  50.4  0.00005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2410  O-antigen polymerase  21.78 
 
 		 426 aa  49.7  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.231968 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2204  hypothetical protein  40 
 
 		 435 aa  48.5  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.556953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02624  membrane protein  28.29 
 
 		 431 aa  47.8  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4434  O-antigen polymerase  21.97 
 
 		 474 aa  47.8  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1980  O-antigen polymerase  25.45 
 
 		 396 aa  47.4  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.638067 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0083  membrane protein  25.29 
 
 		 443 aa  46.6  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.735968  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2436  O-antigen polymerase  27.45 
 
 		 894 aa  46.2  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0069  O-antigen polymerase  25.29 
 
 		 443 aa  45.1  0.003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3959  O-antigen polymerase  21.83 
 
 		 417 aa  44.7  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0194478  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0142  O-antigen polymerase  25.56 
 
 		 496 aa  44.7  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4049  O-antigen polymerase  21.83 
 
 		 417 aa  44.3  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0576542  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03479  Lipid A-core, surface polymer ligase  22.27 
 
 		 417 aa  43.9  0.006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.120571  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03430  hypothetical protein  22.27 
 
 		 417 aa  43.9  0.006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0910551  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0319  O-antigen polymerase  24.85 
 
 		 422 aa  43.1  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7045  putative O-antigen polymerase  18.77 
 
 		 448 aa  43.1  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0087  O-antigen polymerase  21.83 
 
 		 417 aa  42.7  0.01  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0556509  normal  0.17743 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3833  O-antigen polymerase  21.83 
 
 		 417 aa  42.7  0.01  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000244631  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0410  O-antigen polymerase  35.06 
 
 		 552 aa  43.1  0.01  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>