34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CBUD_0338 on replicon NC_009727
Organism: Coxiella burnetii Dugway 5J108-111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010117  COXBURSA331_A1851  hypothetical protein  99.3 
 
 		 429 aa  870    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0338  O-antigen ligase  100 
 
 		 436 aa  890    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2310  O-antigen polymerase  28.5 
 
 		 426 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1698  O-antigen polymerase  28.5 
 
 		 426 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2333  O-antigen polymerase  27.96 
 
 		 426 aa  110  6e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0425881 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5652  O-antigen polymerase  27.59 
 
 		 426 aa  103  5e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0392  O-antigen polymerase  26.38 
 
 		 398 aa  102  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000178586  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0853  hypothetical protein  25.42 
 
 		 416 aa  98.6  2e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0884  hypothetical protein  25.06 
 
 		 416 aa  95.9  1e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2075  O-antigen polymerase  26.56 
 
 		 432 aa  92.8  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.123759  normal  0.0828112 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2229  O-antigen polymerase  25.94 
 
 		 426 aa  90.9  4e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.541391  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4092  O-antigen polymerase  27.4 
 
 		 415 aa  90.1  7e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2349  O-antigen polymerase  25.44 
 
 		 426 aa  89.4  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1804  hypothetical protein  25.68 
 
 		 410 aa  80.1  0.00000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0307014 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5667  putative O-antigen ligase  22.53 
 
 		 427 aa  72.4  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304337  normal  0.482234 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1980  O-antigen polymerase  22.42 
 
 		 396 aa  68.6  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.638067 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3646  O-antigen polymerase  25.17 
 
 		 410 aa  67.8  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0851  O-antigen polymerase domain-containing protein  25.17 
 
 		 410 aa  67.8  0.0000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.852584 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3515  O-antigen polymerase domain-containing protein  25.17 
 
 		 410 aa  67.8  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2053  O-antigen polymerase  24.19 
 
 		 405 aa  66.2  0.0000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1774  O-antigen polymerase  25.51 
 
 		 418 aa  64.3  0.000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00226394  normal  0.0339661 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2801  O-antigen polymerase  22.73 
 
 		 434 aa  63.9  0.000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2006  O-antigen polymerase  28.16 
 
 		 426 aa  63.2  0.000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.188841  normal  0.439827 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2401  O-antigen polymerase  29.24 
 
 		 426 aa  62.8  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0523174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7045  putative O-antigen polymerase  23.33 
 
 		 448 aa  59.7  0.00000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0408  O-antigen polymerase  30.99 
 
 		 407 aa  54.7  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00264178 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0232  O-antigen polymerase family protein  30.99 
 
 		 417 aa  54.7  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0581783  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1639  hypothetical protein  33.05 
 
 		 447 aa  51.6  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04059  O-Antigen Polymerase family  30.83 
 
 		 425 aa  48.5  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2750  O-antigen polymerase  26.43 
 
 		 489 aa  47.4  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.205692 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2410  O-antigen polymerase  23.46 
 
 		 426 aa  47  0.0007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.231968 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0267  O-antigen polymerase  35.42 
 
 		 430 aa  45.4  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1811  O-antigen polymerase  26.89 
 
 		 417 aa  44.3  0.004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2712  O-antigen polymerase  26.19 
 
 		 413 aa  43.1  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0646679  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>