52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_1804 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_1804  hypothetical protein  100 
 
 
410 aa  819    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0307014 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0392  O-antigen polymerase  38.78 
 
 
398 aa  295  1e-78  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000178586  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1811  O-antigen polymerase  29.14 
 
 
417 aa  94.4  4e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0853  hypothetical protein  25.54 
 
 
416 aa  89.7  7e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2075  O-antigen polymerase  27.09 
 
 
432 aa  88.6  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.123759  normal  0.0828112 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1851  hypothetical protein  25.68 
 
 
429 aa  85.9  0.000000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0338  O-antigen ligase  25.68 
 
 
436 aa  85.9  0.000000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1699  O-antigen polymerase  27.1 
 
 
401 aa  85.1  0.000000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4092  O-antigen polymerase  28.19 
 
 
415 aa  80.1  0.00000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0884  hypothetical protein  23.92 
 
 
416 aa  79.7  0.00000000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3646  O-antigen polymerase  27.52 
 
 
410 aa  79  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0851  O-antigen polymerase domain-containing protein  27.52 
 
 
410 aa  79  0.0000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.852584 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3515  O-antigen polymerase domain-containing protein  27.52 
 
 
410 aa  79  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5652  O-antigen polymerase  27.36 
 
 
426 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2310  O-antigen polymerase  26.3 
 
 
426 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1698  O-antigen polymerase  26.3 
 
 
426 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2333  O-antigen polymerase  25.62 
 
 
426 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0425881 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5667  putative O-antigen ligase  28.08 
 
 
427 aa  70.5  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304337  normal  0.482234 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2801  O-antigen polymerase  25.99 
 
 
434 aa  67  0.0000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1774  O-antigen polymerase  26.85 
 
 
418 aa  65.5  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00226394  normal  0.0339661 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7045  putative O-antigen polymerase  26.44 
 
 
448 aa  65.1  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0408  O-antigen polymerase  25.82 
 
 
407 aa  63.9  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00264178 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0232  O-antigen polymerase family protein  25.82 
 
 
417 aa  63.5  0.000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0581783  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2006  O-antigen polymerase  25.27 
 
 
426 aa  63.5  0.000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.188841  normal  0.439827 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1980  O-antigen polymerase  27.27 
 
 
396 aa  63.2  0.000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.638067 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2401  O-antigen polymerase  24.46 
 
 
426 aa  62.4  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0523174  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2229  O-antigen polymerase  25.19 
 
 
426 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.541391  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2349  O-antigen polymerase  24.6 
 
 
426 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0602  lipid A core--O-antigen ligase  24.74 
 
 
416 aa  57  0.0000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02935  hypothetical protein  25.36 
 
 
408 aa  52  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2053  O-antigen polymerase  25.74 
 
 
405 aa  50.4  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18850  O-antigen polymerase  23.53 
 
 
393 aa  49.7  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3579  O-antigen polymerase  25.76 
 
 
501 aa  49.3  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0650  O-antigen polymerase family protein  24.6 
 
 
595 aa  48.5  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1388  O-antigen polymerase  25.51 
 
 
452 aa  47.8  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0980  O-antigen polymerase family protein  24.6 
 
 
661 aa  47.4  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2712  O-antigen polymerase  30.43 
 
 
413 aa  47.4  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0646679  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0234  O-antigen polymerase  28.07 
 
 
402 aa  47.4  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0279  O-antigen polymerase family protein  24.6 
 
 
595 aa  47  0.0006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.297863  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0010  O-antigen polymerase family protein  24.6 
 
 
595 aa  47  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0817  O-antigen polymerase family protein  24.6 
 
 
595 aa  47  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2397  O-antigen polymerase family protein  24.6 
 
 
595 aa  47  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.233574  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2679  O-antigen polymerase family protein  24.6 
 
 
595 aa  47  0.0006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0821  O-antigen polymerase family protein  24.6 
 
 
595 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1241  hypothetical protein  24.55 
 
 
396 aa  46.2  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0456  hypothetical protein  23.22 
 
 
438 aa  45.1  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2410  O-antigen polymerase  25.52 
 
 
426 aa  45.1  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.231968 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0657  O-antigen polymerase  23.02 
 
 
593 aa  43.9  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0083  O-antigen polymerase  29.37 
 
 
419 aa  43.5  0.006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0973021  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2018  O-antigen polymerase  23.95 
 
 
456 aa  43.5  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002359  lipid A core-O-antigen ligase  26.56 
 
 
561 aa  43.1  0.008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0368  O-antigen polymerase  25 
 
 
579 aa  43.1  0.01  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>