54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1811 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_1811  O-antigen polymerase  100 
 
 
417 aa  830    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1699  O-antigen polymerase  34.93 
 
 
401 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1804  hypothetical protein  29.41 
 
 
410 aa  104  2e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0307014 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0392  O-antigen polymerase  26.87 
 
 
398 aa  101  3e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000178586  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0884  hypothetical protein  30.85 
 
 
416 aa  85.9  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0853  hypothetical protein  30.85 
 
 
416 aa  84.7  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2075  O-antigen polymerase  28.07 
 
 
432 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.123759  normal  0.0828112 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0408  O-antigen polymerase  27.6 
 
 
407 aa  73.2  0.000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00264178 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0232  O-antigen polymerase family protein  27.6 
 
 
417 aa  73.2  0.000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0581783  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5652  O-antigen polymerase  26.45 
 
 
426 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1698  O-antigen polymerase  29.33 
 
 
426 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2310  O-antigen polymerase  29.33 
 
 
426 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2333  O-antigen polymerase  29.33 
 
 
426 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0425881 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1429  O-antigen polymerase  25.86 
 
 
405 aa  68.2  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0418  O-antigen polymerase  25.15 
 
 
431 aa  66.2  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3515  O-antigen polymerase domain-containing protein  28.32 
 
 
410 aa  60.8  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0851  O-antigen polymerase domain-containing protein  28.32 
 
 
410 aa  60.8  0.00000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.852584 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3646  O-antigen polymerase  28.32 
 
 
410 aa  60.8  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0602  lipid A core--O-antigen ligase  23.89 
 
 
416 aa  58.5  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4092  O-antigen polymerase  24.93 
 
 
415 aa  56.2  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2349  O-antigen polymerase  28.28 
 
 
426 aa  56.2  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2229  O-antigen polymerase  28.15 
 
 
426 aa  55.5  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.541391  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2401  O-antigen polymerase  28.7 
 
 
426 aa  54.3  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0523174  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2712  O-antigen polymerase  28.4 
 
 
413 aa  54.3  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0646679  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2801  O-antigen polymerase  26.85 
 
 
434 aa  53.9  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2006  O-antigen polymerase  30.71 
 
 
426 aa  52.4  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.188841  normal  0.439827 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1851  hypothetical protein  26.01 
 
 
429 aa  52.4  0.00001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3401  polysaccharide deacetylase  25.78 
 
 
464 aa  52.8  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.264275  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0338  O-antigen ligase  26.34 
 
 
436 aa  52.8  0.00001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5667  putative O-antigen ligase  27.43 
 
 
427 aa  52.4  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304337  normal  0.482234 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1980  O-antigen polymerase  25 
 
 
396 aa  51.6  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.638067 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0319  O-antigen polymerase  30.1 
 
 
422 aa  51.2  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1774  O-antigen polymerase  24.74 
 
 
418 aa  51.2  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00226394  normal  0.0339661 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2204  hypothetical protein  26.15 
 
 
435 aa  50.8  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.556953  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3103  O-antigen polymerase  28.95 
 
 
498 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.313581  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2674  O-antigen polymerase  26.48 
 
 
592 aa  47  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3581  O-antigen polymerase  31.19 
 
 
429 aa  47  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.143797  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2645  O-antigen polymerase  26.48 
 
 
592 aa  47  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2034  O-antigen polymerase  26.48 
 
 
592 aa  47  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7045  putative O-antigen polymerase  25.17 
 
 
448 aa  46.2  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2410  O-antigen polymerase  27.55 
 
 
426 aa  45.8  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.231968 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0980  O-antigen polymerase family protein  36.96 
 
 
661 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0103  O-antigen polymerase  29.67 
 
 
492 aa  45.1  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0010  O-antigen polymerase family protein  36.96 
 
 
595 aa  44.7  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0817  O-antigen polymerase family protein  36.96 
 
 
595 aa  45.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2397  O-antigen polymerase family protein  36.96 
 
 
595 aa  44.7  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.233574  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2679  O-antigen polymerase family protein  36.96 
 
 
595 aa  44.7  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1940  O-antigen polymerase  33.67 
 
 
453 aa  44.7  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0279  O-antigen polymerase family protein  36.96 
 
 
595 aa  44.7  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.297863  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0821  O-antigen polymerase family protein  36.96 
 
 
595 aa  43.9  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1404  hypothetical protein  32.05 
 
 
448 aa  43.9  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.709 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0508  O-antigen polymerase  34.57 
 
 
440 aa  43.9  0.006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2478  O-antigen polymerase  28.71 
 
 
415 aa  43.5  0.007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0650  O-antigen polymerase family protein  33.98 
 
 
595 aa  43.5  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>