30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1774 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_1774  O-antigen polymerase  100 
 
 
418 aa  843    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00226394  normal  0.0339661 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4092  O-antigen polymerase  54.4 
 
 
415 aa  395  1e-109  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3646  O-antigen polymerase  53.12 
 
 
410 aa  387  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0851  O-antigen polymerase domain-containing protein  53.12 
 
 
410 aa  387  1e-106  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.852584 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3515  O-antigen polymerase domain-containing protein  53.12 
 
 
410 aa  387  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1698  O-antigen polymerase  32.34 
 
 
426 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2310  O-antigen polymerase  32.34 
 
 
426 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2333  O-antigen polymerase  31.34 
 
 
426 aa  99.4  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0425881 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5652  O-antigen polymerase  32.65 
 
 
426 aa  97.8  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2075  O-antigen polymerase  29.46 
 
 
432 aa  82.8  0.000000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.123759  normal  0.0828112 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2229  O-antigen polymerase  30.18 
 
 
426 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.541391  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2349  O-antigen polymerase  30.68 
 
 
426 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0853  hypothetical protein  26.52 
 
 
416 aa  76.6  0.0000000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0884  hypothetical protein  25.61 
 
 
416 aa  74.7  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5667  putative O-antigen ligase  25.77 
 
 
427 aa  68.6  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304337  normal  0.482234 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0338  O-antigen ligase  25.51 
 
 
436 aa  64.7  0.000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1851  hypothetical protein  25.76 
 
 
429 aa  64.3  0.000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2801  O-antigen polymerase  27.39 
 
 
434 aa  62.8  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2410  O-antigen polymerase  26.34 
 
 
426 aa  61.6  0.00000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.231968 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1699  O-antigen polymerase  25.6 
 
 
401 aa  60.1  0.00000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1804  hypothetical protein  26.82 
 
 
410 aa  57  0.0000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0307014 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0392  O-antigen polymerase  23.67 
 
 
398 aa  57  0.0000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000178586  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1980  O-antigen polymerase  25.08 
 
 
396 aa  56.6  0.0000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.638067 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0408  O-antigen polymerase  26.69 
 
 
407 aa  54.3  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00264178 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0232  O-antigen polymerase family protein  26.69 
 
 
417 aa  54.3  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0581783  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2053  O-antigen polymerase  27.1 
 
 
405 aa  52  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7045  putative O-antigen polymerase  25.98 
 
 
448 aa  50.8  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1811  O-antigen polymerase  23.05 
 
 
417 aa  45.4  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0418  O-antigen polymerase  24.32 
 
 
431 aa  45.1  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3526  O-antigen polymerase  25.66 
 
 
668 aa  44.7  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000131402  normal  0.176407 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>