55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0319 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_0319  O-antigen polymerase  100 
 
 		 422 aa  838    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0184  O-antigen polymerase  42.55 
 
 		 435 aa  267  2e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.146439  normal  0.684402 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0267  O-antigen polymerase  44.28 
 
 		 430 aa  250  3e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2478  O-antigen polymerase  38.93 
 
 		 415 aa  201  1.9999999999999998e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0206  O-antigen polymerase  31.99 
 
 		 444 aa  145  1e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0333  O-antigen polymerase  27.27 
 
 		 416 aa  106  8e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0263  O-antigen ligase WaaL  28.57 
 
 		 408 aa  95.9  1e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0160  O-antigen ligase WaaL  28.57 
 
 		 408 aa  95.9  1e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2204  hypothetical protein  26.94 
 
 		 435 aa  86.3  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.556953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3774  O-antigen polymerase  28.52 
 
 		 439 aa  83.2  0.000000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1511  O-antigen polymerase  34.3 
 
 		 436 aa  80.5  0.00000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.995807  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2006  O-antigen polymerase  32.14 
 
 		 426 aa  75.1  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.188841  normal  0.439827 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04059  O-Antigen Polymerase family  27.53 
 
 		 425 aa  73.9  0.000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2401  O-antigen polymerase  27.27 
 
 		 426 aa  73.2  0.000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0523174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2712  O-antigen polymerase  24.54 
 
 		 413 aa  68.2  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0646679  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0861  O-antigen polymerase  28.06 
 
 		 409 aa  67  0.0000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0980  hypothetical protein  28.14 
 
 		 409 aa  66.2  0.0000000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0759  O-antigen polymerase  26.96 
 
 		 430 aa  58.5  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.402812  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2333  O-antigen polymerase  28.74 
 
 		 426 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0425881 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2617  hypothetical protein  25.49 
 
 		 399 aa  57.4  0.0000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1698  O-antigen polymerase  28.74 
 
 		 426 aa  57  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2310  O-antigen polymerase  28.74 
 
 		 426 aa  57  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5652  O-antigen polymerase  29.3 
 
 		 426 aa  57  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0257  O-antigen polymerase  28.4 
 
 		 419 aa  55.1  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2075  O-antigen polymerase  27.96 
 
 		 432 aa  55.1  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.123759  normal  0.0828112 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1694  O-antigen polymerase  27.43 
 
 		 446 aa  54.7  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000414796  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0780  O-antigen polymerase  30.39 
 
 		 415 aa  54.7  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.292399  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7045  putative O-antigen polymerase  29.11 
 
 		 448 aa  52.4  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6494  O-antigen polymerase  27.46 
 
 		 424 aa  52  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3581  O-antigen polymerase  30.5 
 
 		 429 aa  51.6  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.143797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1654  O-antigen polymerase  27.23 
 
 		 754 aa  52  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1811  O-antigen polymerase  24.58 
 
 		 417 aa  52  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2053  O-antigen polymerase  32.26 
 
 		 405 aa  51.2  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6004  O-antigen polymerase  26.64 
 
 		 424 aa  50.8  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.881514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0087  O-antigen polymerase  23.14 
 
 		 417 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0556509  normal  0.17743 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3833  O-antigen polymerase  23.14 
 
 		 417 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000244631  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4372  O-antigen polymerase  26.87 
 
 		 427 aa  48.1  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03430  hypothetical protein  22.32 
 
 		 417 aa  47.8  0.0004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0910551  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03479  Lipid A-core, surface polymer ligase  22.32 
 
 		 417 aa  47.8  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.120571  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1285  O-antigen polymerase  26.24 
 
 		 418 aa  47.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1314  O-antigen polymerase  25.79 
 
 		 418 aa  47.4  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.963126 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4049  O-antigen polymerase  22.71 
 
 		 417 aa  46.6  0.0007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0576542  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4125  O-antigen polymerase  22.81 
 
 		 417 aa  46.6  0.0009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.314741  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2018  O-antigen polymerase  33.33 
 
 		 456 aa  46.2  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2349  O-antigen polymerase  28 
 
 		 426 aa  45.8  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0069  O-antigen polymerase  30.46 
 
 		 443 aa  46.2  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2229  O-antigen polymerase  28 
 
 		 426 aa  45.8  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.541391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3959  O-antigen polymerase  23.04 
 
 		 417 aa  46.2  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0194478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3309  hypothetical protein  29.35 
 
 		 471 aa  45.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.110006  normal  0.406179 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1374  O-antigen polymerase  26.92 
 
 		 426 aa  45.8  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.247054  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1973  O-antigen polymerase  26.43 
 
 		 433 aa  44.7  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.15228 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1869  O-antigen polymerase  31.68 
 
 		 459 aa  45.1  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0083  membrane protein  29.89 
 
 		 443 aa  44.7  0.004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.735968  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0853  hypothetical protein  23.78 
 
 		 416 aa  43.5  0.006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3696  O-antigen polymerase  27.27 
 
 		 461 aa  43.1  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.312837 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>