33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1699 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_1699  O-antigen polymerase  100 
 
 
401 aa  799    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1811  O-antigen polymerase  35.28 
 
 
417 aa  192  7e-48  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0392  O-antigen polymerase  26.98 
 
 
398 aa  124  3e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000178586  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1804  hypothetical protein  28.02 
 
 
410 aa  107  4e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0307014 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4092  O-antigen polymerase  23.92 
 
 
415 aa  76.6  0.0000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1774  O-antigen polymerase  23.08 
 
 
418 aa  70.5  0.00000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00226394  normal  0.0339661 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1429  O-antigen polymerase  26.79 
 
 
405 aa  69.7  0.00000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0853  hypothetical protein  24.5 
 
 
416 aa  63.9  0.000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2712  O-antigen polymerase  27.44 
 
 
413 aa  63.5  0.000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0646679  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0884  hypothetical protein  24.5 
 
 
416 aa  63.5  0.000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0418  O-antigen polymerase  27.5 
 
 
431 aa  62.4  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0408  O-antigen polymerase  22.99 
 
 
407 aa  55.1  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00264178 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2401  O-antigen polymerase  23.2 
 
 
426 aa  55.5  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0523174  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0232  O-antigen polymerase family protein  23.75 
 
 
417 aa  54.7  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0581783  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2006  O-antigen polymerase  23.68 
 
 
426 aa  53.9  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.188841  normal  0.439827 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3646  O-antigen polymerase  27.89 
 
 
410 aa  50.1  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0851  O-antigen polymerase domain-containing protein  27.89 
 
 
410 aa  50.1  0.00007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.852584 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3515  O-antigen polymerase domain-containing protein  27.89 
 
 
410 aa  50.1  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1851  hypothetical protein  22.19 
 
 
429 aa  49.7  0.00009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0338  O-antigen ligase  21.93 
 
 
436 aa  48.5  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7045  putative O-antigen polymerase  22.51 
 
 
448 aa  48.1  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2075  O-antigen polymerase  23.04 
 
 
432 aa  47.4  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.123759  normal  0.0828112 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5652  O-antigen polymerase  22.34 
 
 
426 aa  46.6  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1980  O-antigen polymerase  24.16 
 
 
396 aa  45.8  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.638067 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2009  O-antigen polymerase  22.87 
 
 
459 aa  45.8  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1694  O-antigen polymerase  27.05 
 
 
446 aa  45.1  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000414796  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5667  putative O-antigen ligase  25.14 
 
 
427 aa  44.7  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304337  normal  0.482234 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2638  O-antigen polymerase  24.41 
 
 
428 aa  44.3  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1691  O-antigen polymerase  25.14 
 
 
512 aa  44.7  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.121195  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2310  O-antigen polymerase  23.56 
 
 
426 aa  44.3  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1698  O-antigen polymerase  23.56 
 
 
426 aa  44.3  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0333  O-antigen polymerase  24.49 
 
 
416 aa  43.5  0.006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0586  O-antigen polymerase  26.27 
 
 
459 aa  43.1  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000335873  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>