31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A0418 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007614  Nmul_A0418  O-antigen polymerase  100 
 
 		 431 aa  861    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1429  O-antigen polymerase  56.7 
 
 		 405 aa  400  9.999999999999999e-111  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1811  O-antigen polymerase  24.55 
 
 		 417 aa  66.2  0.000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3774  O-antigen polymerase  27.78 
 
 		 439 aa  62.8  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1699  O-antigen polymerase  27.5 
 
 		 401 aa  61.6  0.00000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2712  O-antigen polymerase  26.11 
 
 		 413 aa  60.5  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0646679  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0884  hypothetical protein  27.32 
 
 		 416 aa  56.6  0.0000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5667  putative O-antigen ligase  22.87 
 
 		 427 aa  56.2  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304337  normal  0.482234 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0853  hypothetical protein  25.96 
 
 		 416 aa  54.3  0.000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2075  O-antigen polymerase  25.62 
 
 		 432 aa  52.8  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.123759  normal  0.0828112 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0392  O-antigen polymerase  21.96 
 
 		 398 aa  52  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000178586  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5652  O-antigen polymerase  26.24 
 
 		 426 aa  50.1  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2333  O-antigen polymerase  26.73 
 
 		 426 aa  50.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0425881 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2006  O-antigen polymerase  26.87 
 
 		 426 aa  50.1  0.00008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.188841  normal  0.439827 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0232  O-antigen polymerase family protein  25.93 
 
 		 417 aa  47.8  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0581783  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2801  O-antigen polymerase  20.07 
 
 		 434 aa  47.4  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0408  O-antigen polymerase  25.93 
 
 		 407 aa  47.8  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00264178 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1511  O-antigen polymerase  31.29 
 
 		 436 aa  47.8  0.0004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.995807  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2310  O-antigen polymerase  26.42 
 
 		 426 aa  47.4  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1698  O-antigen polymerase  26.42 
 
 		 426 aa  47.4  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7045  putative O-antigen polymerase  24.71 
 
 		 448 aa  46.6  0.0009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0083  O-antigen polymerase  26.87 
 
 		 419 aa  46.6  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0973021  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1774  O-antigen polymerase  24.59 
 
 		 418 aa  45.8  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00226394  normal  0.0339661 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2401  O-antigen polymerase  24.34 
 
 		 426 aa  46.2  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0523174  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2204  hypothetical protein  27.71 
 
 		 435 aa  45.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.556953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2813  O-antigen polymerase  27.92 
 
 		 773 aa  45.4  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.192356  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1650  hypothetical protein  25.14 
 
 		 404 aa  45.1  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.192586  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3695  hypothetical protein  25.14 
 
 		 404 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0843  O-antigen polymerase  24.63 
 
 		 440 aa  44.3  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.475178  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6004  O-antigen polymerase  24.82 
 
 		 424 aa  43.1  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.881514  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2410  O-antigen polymerase  25.16 
 
 		 426 aa  43.1  0.01  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.231968 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>