35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_3774 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_3774  O-antigen polymerase  100 
 
 		 439 aa  879    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2712  O-antigen polymerase  29.39 
 
 		 413 aa  82.4  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0646679  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0160  O-antigen ligase WaaL  25.88 
 
 		 408 aa  68.6  0.0000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0263  O-antigen ligase WaaL  25.88 
 
 		 408 aa  68.6  0.0000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0333  O-antigen polymerase  24.02 
 
 		 416 aa  68.9  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2204  hypothetical protein  27.17 
 
 		 435 aa  67.4  0.0000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.556953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2617  hypothetical protein  25.26 
 
 		 399 aa  66.6  0.0000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2478  O-antigen polymerase  26.77 
 
 		 415 aa  65.1  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0319  O-antigen polymerase  28.52 
 
 		 422 aa  64.3  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2401  O-antigen polymerase  24.83 
 
 		 426 aa  61.2  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0523174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0780  O-antigen polymerase  28.08 
 
 		 415 aa  60.1  0.00000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.292399  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2006  O-antigen polymerase  24.48 
 
 		 426 aa  58.2  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.188841  normal  0.439827 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0843  O-antigen polymerase  22.95 
 
 		 440 aa  57.8  0.0000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.475178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1694  O-antigen polymerase  25.36 
 
 		 446 aa  56.2  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000414796  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6004  O-antigen polymerase  29.41 
 
 		 424 aa  55.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.881514  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0418  O-antigen polymerase  26.12 
 
 		 431 aa  55.1  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1497  O-antigen polymerase  31.1 
 
 		 672 aa  53.5  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0980  hypothetical protein  26.6 
 
 		 409 aa  53.5  0.000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0142  O-antigen polymerase  30.37 
 
 		 496 aa  52.4  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3401  polysaccharide deacetylase  28.67 
 
 		 464 aa  52  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.264275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1429  O-antigen polymerase  27.06 
 
 		 405 aa  50.8  0.00004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0861  O-antigen polymerase  26.6 
 
 		 409 aa  50.8  0.00004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6494  O-antigen polymerase  28.34 
 
 		 424 aa  50.4  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5004  O-antigen polymerase family protein  34.69 
 
 		 436 aa  49.3  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04059  O-Antigen Polymerase family  27.39 
 
 		 425 aa  49.7  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0759  O-antigen polymerase  30.67 
 
 		 430 aa  47.8  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.402812  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0184  O-antigen polymerase  26.21 
 
 		 435 aa  47.4  0.0005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.146439  normal  0.684402 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3951  O-antigen polymerase  25 
 
 		 402 aa  47  0.0008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3581  O-antigen polymerase  30.68 
 
 		 429 aa  46.6  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.143797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1374  O-antigen polymerase  21.84 
 
 		 426 aa  45.8  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.247054  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1511  O-antigen polymerase  25 
 
 		 436 aa  46.2  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.995807  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0314  O-antigen polymerase  38.2 
 
 		 397 aa  45.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5249  O-antigen polymerase  27.04 
 
 		 671 aa  44.7  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.566036  normal  0.80633 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0206  O-antigen polymerase  27.46 
 
 		 444 aa  44.7  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26080  lipid A core-O-antigen ligase-like enyme  30.17 
 
 		 655 aa  44.7  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>