24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_0083 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_0083  O-antigen polymerase  100 
 
 		 419 aa  825    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0973021  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4372  O-antigen polymerase  33.93 
 
 		 427 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4374  O-antigen polymerase  32 
 
 		 410 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4049  O-antigen polymerase  31.31 
 
 		 417 aa  161  2e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0576542  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3959  O-antigen polymerase  30.38 
 
 		 417 aa  160  3e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0194478  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03479  Lipid A-core, surface polymer ligase  31.06 
 
 		 417 aa  160  5e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.120571  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03430  hypothetical protein  31.06 
 
 		 417 aa  160  5e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0910551  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4125  O-antigen polymerase  30.38 
 
 		 417 aa  159  7e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.314741  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3833  O-antigen polymerase  30.13 
 
 		 417 aa  159  9e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000244631  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0087  O-antigen polymerase  30.13 
 
 		 417 aa  159  9e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0556509  normal  0.17743 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2006  O-antigen polymerase  24.68 
 
 		 426 aa  63.9  0.000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.188841  normal  0.439827 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2401  O-antigen polymerase  25.61 
 
 		 426 aa  62.4  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0523174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2712  O-antigen polymerase  26.67 
 
 		 413 aa  60.8  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0646679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1429  O-antigen polymerase  27.05 
 
 		 405 aa  58.5  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6004  O-antigen polymerase  25.2 
 
 		 424 aa  49.7  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.881514  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0759  O-antigen polymerase  26.38 
 
 		 430 aa  47.4  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.402812  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6494  O-antigen polymerase  24.41 
 
 		 424 aa  47.8  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0418  O-antigen polymerase  26.52 
 
 		 431 aa  47.4  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2478  O-antigen polymerase  23.49 
 
 		 415 aa  45.1  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2204  hypothetical protein  21.86 
 
 		 435 aa  45.1  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.556953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2801  O-antigen polymerase  20.86 
 
 		 434 aa  44.7  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1804  hypothetical protein  29.37 
 
 		 410 aa  44.3  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0307014 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0780  O-antigen polymerase  32.26 
 
 		 415 aa  43.9  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.292399  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2617  hypothetical protein  24.48 
 
 		 399 aa  43.5  0.007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>