44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl0853 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006368  lpp0884  hypothetical protein  96.63 
 
 		 416 aa  756    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0853  hypothetical protein  100 
 
 		 416 aa  846    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2333  O-antigen polymerase  26.29 
 
 		 426 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0425881 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1698  O-antigen polymerase  26.55 
 
 		 426 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2310  O-antigen polymerase  26.55 
 
 		 426 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0338  O-antigen ligase  27.16 
 
 		 436 aa  109  1e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5652  O-antigen polymerase  27.11 
 
 		 426 aa  107  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1851  hypothetical protein  27.16 
 
 		 429 aa  107  4e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2349  O-antigen polymerase  24.68 
 
 		 426 aa  93.6  6e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1804  hypothetical protein  25.06 
 
 		 410 aa  92  2e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0307014 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2229  O-antigen polymerase  24.68 
 
 		 426 aa  92  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.541391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2075  O-antigen polymerase  23.94 
 
 		 432 aa  90.5  5e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.123759  normal  0.0828112 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3646  O-antigen polymerase  28.3 
 
 		 410 aa  89.7  8e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0851  O-antigen polymerase domain-containing protein  28.3 
 
 		 410 aa  89.7  8e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.852584 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3515  O-antigen polymerase domain-containing protein  28.3 
 
 		 410 aa  89.7  8e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4092  O-antigen polymerase  27.11 
 
 		 415 aa  87.8  3e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1811  O-antigen polymerase  32.91 
 
 		 417 aa  85.1  0.000000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1774  O-antigen polymerase  26.52 
 
 		 418 aa  78.2  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00226394  normal  0.0339661 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0392  O-antigen polymerase  28.17 
 
 		 398 aa  75.1  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000178586  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1699  O-antigen polymerase  24.37 
 
 		 401 aa  67.8  0.0000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5667  putative O-antigen ligase  24.37 
 
 		 427 aa  63.2  0.000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304337  normal  0.482234 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2801  O-antigen polymerase  20.17 
 
 		 434 aa  57.8  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0232  O-antigen polymerase family protein  23.98 
 
 		 417 aa  57.8  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0581783  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0408  O-antigen polymerase  23.98 
 
 		 407 aa  57.8  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00264178 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2006  O-antigen polymerase  21.56 
 
 		 426 aa  57  0.0000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.188841  normal  0.439827 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0418  O-antigen polymerase  25 
 
 		 431 aa  55.8  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2401  O-antigen polymerase  24.42 
 
 		 426 aa  55.1  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0523174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1429  O-antigen polymerase  25.7 
 
 		 405 aa  54.3  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04059  O-Antigen Polymerase family  23.31 
 
 		 425 aa  52  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2617  hypothetical protein  24.87 
 
 		 399 aa  51.6  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2712  O-antigen polymerase  26.55 
 
 		 413 aa  48.9  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0646679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1980  O-antigen polymerase  26.36 
 
 		 396 aa  49.3  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.638067 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2410  O-antigen polymerase  22.35 
 
 		 426 aa  49.7  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.231968 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0142  O-antigen polymerase  26.32 
 
 		 496 aa  48.5  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2204  hypothetical protein  26.25 
 
 		 435 aa  47.8  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.556953  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2436  O-antigen polymerase  29.41 
 
 		 894 aa  47.8  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0319  O-antigen polymerase  25.64 
 
 		 422 aa  46.2  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2694  O-antigen polymerase  33.77 
 
 		 535 aa  45.4  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.247958  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0083  membrane protein  25.17 
 
 		 443 aa  44.7  0.003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.735968  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4434  O-antigen polymerase  21.21 
 
 		 474 aa  45.1  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7045  putative O-antigen polymerase  18.77 
 
 		 448 aa  44.3  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02624  membrane protein  27.33 
 
 		 431 aa  43.5  0.008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1394  O-antigen polymerase  24.89 
 
 		 399 aa  43.1  0.009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0739482 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0069  O-antigen polymerase  25.17 
 
 		 443 aa  43.1  0.01  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>