29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_0232 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_0232  O-antigen polymerase family protein  100 
 
 		 417 aa  826    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0581783  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0408  O-antigen polymerase  100 
 
 		 407 aa  805    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00264178 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2333  O-antigen polymerase  26.25 
 
 		 426 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0425881 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2310  O-antigen polymerase  26.04 
 
 		 426 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1698  O-antigen polymerase  26.04 
 
 		 426 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1811  O-antigen polymerase  29.25 
 
 		 417 aa  70.5  0.00000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0884  hypothetical protein  28.02 
 
 		 416 aa  65.5  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5652  O-antigen polymerase  24.54 
 
 		 426 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1804  hypothetical protein  25.82 
 
 		 410 aa  63.5  0.000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0307014 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2075  O-antigen polymerase  26.12 
 
 		 432 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.123759  normal  0.0828112 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0392  O-antigen polymerase  25.9 
 
 		 398 aa  60.8  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000178586  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0338  O-antigen ligase  25.63 
 
 		 436 aa  59.7  0.00000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1851  hypothetical protein  25.35 
 
 		 429 aa  59.7  0.0000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0853  hypothetical protein  23.98 
 
 		 416 aa  56.2  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1774  O-antigen polymerase  26.69 
 
 		 418 aa  54.7  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00226394  normal  0.0339661 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2712  O-antigen polymerase  23.83 
 
 		 413 aa  53.9  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0646679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1699  O-antigen polymerase  24.18 
 
 		 401 aa  53.9  0.000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2478  O-antigen polymerase  27.88 
 
 		 415 aa  52.8  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2229  O-antigen polymerase  22.68 
 
 		 426 aa  51.2  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.541391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2349  O-antigen polymerase  23.39 
 
 		 426 aa  50.8  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0780  O-antigen polymerase  31.62 
 
 		 415 aa  50.4  0.00006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.292399  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0508  O-antigen polymerase  32.48 
 
 		 440 aa  48.5  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1429  O-antigen polymerase  26.25 
 
 		 405 aa  47.4  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2401  O-antigen polymerase  23.16 
 
 		 426 aa  46.2  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0523174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0418  O-antigen polymerase  27.44 
 
 		 431 aa  46.2  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2006  O-antigen polymerase  24.21 
 
 		 426 aa  45.4  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.188841  normal  0.439827 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2204  hypothetical protein  28 
 
 		 435 aa  45.8  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.556953  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0257  O-antigen polymerase  25.19 
 
 		 419 aa  43.9  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4007  major facilitator superfamily MFS_1  28.32 
 
 		 419 aa  43.9  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>