49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_0780 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_0780  O-antigen polymerase  100 
 
 		 415 aa  829    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.292399  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2204  hypothetical protein  25.99 
 
 		 435 aa  84.7  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.556953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3774  O-antigen polymerase  26.69 
 
 		 439 aa  79  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0160  O-antigen ligase WaaL  32.48 
 
 		 408 aa  75.1  0.000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0263  O-antigen ligase WaaL  32.48 
 
 		 408 aa  75.1  0.000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2006  O-antigen polymerase  26.33 
 
 		 426 aa  74.7  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.188841  normal  0.439827 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2401  O-antigen polymerase  25.18 
 
 		 426 aa  73.6  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0523174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2617  hypothetical protein  26.5 
 
 		 399 aa  72.8  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0206  O-antigen polymerase  31.36 
 
 		 444 aa  63.9  0.000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2478  O-antigen polymerase  27.52 
 
 		 415 aa  61.6  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0267  O-antigen polymerase  30.42 
 
 		 430 aa  60.8  0.00000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2712  O-antigen polymerase  25 
 
 		 413 aa  60.1  0.00000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0646679  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0232  O-antigen polymerase family protein  31.17 
 
 		 417 aa  60.1  0.00000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0581783  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0408  O-antigen polymerase  31.17 
 
 		 407 aa  60.1  0.00000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00264178 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0184  O-antigen polymerase  30.53 
 
 		 435 aa  56.6  0.0000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.146439  normal  0.684402 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0392  O-antigen polymerase  22.03 
 
 		 398 aa  55.5  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000178586  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3581  O-antigen polymerase  29.91 
 
 		 429 aa  53.5  0.000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.143797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3078  O-antigen polymerase  28.69 
 
 		 500 aa  53.1  0.000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0759  O-antigen polymerase  27.14 
 
 		 430 aa  52.4  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.402812  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0319  O-antigen polymerase  27.05 
 
 		 422 aa  52  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04059  O-Antigen Polymerase family  26.29 
 
 		 425 aa  52.4  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1788  O-antigen polymerase  29.15 
 
 		 446 aa  51.2  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0333  O-antigen polymerase  23.76 
 
 		 416 aa  50.8  0.00004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0297  hypothetical protein  24.76 
 
 		 428 aa  50.8  0.00004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.515931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5652  O-antigen polymerase  26.67 
 
 		 426 aa  50.1  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2333  O-antigen polymerase  26.11 
 
 		 426 aa  49.7  0.00009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0425881 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1374  O-antigen polymerase  25.68 
 
 		 426 aa  49.7  0.00009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.247054  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1511  O-antigen polymerase  24.46 
 
 		 436 aa  49.7  0.00009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.995807  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0287  O-antigen polymerase  25.23 
 
 		 415 aa  49.3  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.509541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1811  O-antigen polymerase  26.45 
 
 		 417 aa  49.3  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3094  O-antigen polymerase  30.17 
 
 		 444 aa  49.3  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1698  O-antigen polymerase  26.11 
 
 		 426 aa  49.7  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2310  O-antigen polymerase  26.11 
 
 		 426 aa  49.7  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0083  O-antigen polymerase  27.69 
 
 		 419 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0973021  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3077  O-antigen polymerase  28.29 
 
 		 504 aa  48.1  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1804  hypothetical protein  27.78 
 
 		 410 aa  47.8  0.0004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0307014 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2459  O-antigen polymerase  26.34 
 
 		 437 aa  47.8  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1429  O-antigen polymerase  28.14 
 
 		 405 aa  47.4  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2638  O-antigen polymerase  25.47 
 
 		 428 aa  46.2  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3515  O-antigen polymerase domain-containing protein  30.2 
 
 		 410 aa  45.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0969  O-antigen polymerase  23.4 
 
 		 446 aa  45.1  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.948168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0851  O-antigen polymerase domain-containing protein  30.2 
 
 		 410 aa  45.4  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.852584 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1699  O-antigen polymerase  24.84 
 
 		 401 aa  45.4  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3646  O-antigen polymerase  30.2 
 
 		 410 aa  45.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2009  O-antigen polymerase  25.31 
 
 		 459 aa  44.3  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1980  O-antigen polymerase  28.76 
 
 		 396 aa  43.9  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.638067 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0843  O-antigen polymerase  25.28 
 
 		 440 aa  43.5  0.008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.475178  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0884  hypothetical protein  29.36 
 
 		 416 aa  43.1  0.008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2080  O-antigen polymerase  32.69 
 
 		 411 aa  43.1  0.01  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.473077  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>