29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0333 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_0333  O-antigen polymerase  100 
 
 		 416 aa  835    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2401  O-antigen polymerase  30.87 
 
 		 426 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0523174  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2006  O-antigen polymerase  31.54 
 
 		 426 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.188841  normal  0.439827 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0263  O-antigen ligase WaaL  27.15 
 
 		 408 aa  104  3e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0160  O-antigen ligase WaaL  27.15 
 
 		 408 aa  104  3e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0319  O-antigen polymerase  27.27 
 
 		 422 aa  101  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0184  O-antigen polymerase  24.88 
 
 		 435 aa  99.8  8e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.146439  normal  0.684402 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0206  O-antigen polymerase  27.48 
 
 		 444 aa  94.4  4e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2204  hypothetical protein  26.14 
 
 		 435 aa  89.4  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.556953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2478  O-antigen polymerase  27.68 
 
 		 415 aa  89.4  1e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6004  O-antigen polymerase  26.81 
 
 		 424 aa  77  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.881514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0267  O-antigen polymerase  23.28 
 
 		 430 aa  76.6  0.0000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6494  O-antigen polymerase  28.09 
 
 		 424 aa  75.1  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3774  O-antigen polymerase  24.02 
 
 		 439 aa  72  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0759  O-antigen polymerase  23.58 
 
 		 430 aa  68.9  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.402812  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2617  hypothetical protein  24.92 
 
 		 399 aa  62  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0969  O-antigen polymerase  25.37 
 
 		 446 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.948168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2712  O-antigen polymerase  22.26 
 
 		 413 aa  55.1  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0646679  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3581  O-antigen polymerase  24.15 
 
 		 429 aa  54.7  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.143797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4125  O-antigen polymerase  24.74 
 
 		 417 aa  50.8  0.00005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.314741  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3833  O-antigen polymerase  24.39 
 
 		 417 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000244631  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0087  O-antigen polymerase  24.39 
 
 		 417 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0556509  normal  0.17743 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3959  O-antigen polymerase  23.79 
 
 		 417 aa  47.8  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0194478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04059  O-Antigen Polymerase family  25.08 
 
 		 425 aa  47  0.0006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3951  O-antigen polymerase  23.5 
 
 		 402 aa  46.6  0.0008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4049  O-antigen polymerase  23.96 
 
 		 417 aa  46.2  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0576542  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03479  Lipid A-core, surface polymer ligase  23.89 
 
 		 417 aa  45.8  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.120571  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03430  hypothetical protein  23.89 
 
 		 417 aa  45.8  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0910551  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4372  O-antigen polymerase  23.85 
 
 		 427 aa  43.5  0.007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>