58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0267 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_0267  O-antigen polymerase  100 
 
 		 430 aa  851    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0184  O-antigen polymerase  60.42 
 
 		 435 aa  489  1e-137  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.146439  normal  0.684402 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0319  O-antigen polymerase  44.47 
 
 		 422 aa  295  1e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2478  O-antigen polymerase  44.84 
 
 		 415 aa  269  7e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0206  O-antigen polymerase  35.95 
 
 		 444 aa  167  2e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0263  O-antigen ligase WaaL  28.02 
 
 		 408 aa  107  4e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0160  O-antigen ligase WaaL  28.02 
 
 		 408 aa  107  4e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0333  O-antigen polymerase  24.71 
 
 		 416 aa  91.3  3e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04059  O-Antigen Polymerase family  30.16 
 
 		 425 aa  86.3  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2401  O-antigen polymerase  27.97 
 
 		 426 aa  70.9  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0523174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2712  O-antigen polymerase  28.39 
 
 		 413 aa  68.9  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0646679  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2006  O-antigen polymerase  27.73 
 
 		 426 aa  65.5  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.188841  normal  0.439827 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0969  O-antigen polymerase  28.37 
 
 		 446 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.948168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1511  O-antigen polymerase  27.27 
 
 		 436 aa  63.2  0.000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.995807  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0780  O-antigen polymerase  31.58 
 
 		 415 aa  62.8  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.292399  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2204  hypothetical protein  28.64 
 
 		 435 aa  58.9  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.556953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0980  hypothetical protein  24.15 
 
 		 409 aa  57.4  0.0000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0861  O-antigen polymerase  24.46 
 
 		 409 aa  57  0.0000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3581  O-antigen polymerase  26.39 
 
 		 429 aa  52.8  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.143797  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3774  O-antigen polymerase  27.14 
 
 		 439 aa  52.8  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1888  hypothetical protein  26.99 
 
 		 415 aa  51.6  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0338  O-antigen ligase  26 
 
 		 436 aa  52  0.00002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2310  O-antigen polymerase  30.37 
 
 		 426 aa  50.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1698  O-antigen polymerase  30.37 
 
 		 426 aa  50.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1851  hypothetical protein  31.95 
 
 		 429 aa  50.8  0.00005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0759  O-antigen polymerase  26.07 
 
 		 430 aa  50.1  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.402812  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2333  O-antigen polymerase  30 
 
 		 426 aa  49.3  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0425881 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3018  O-antigen polymerase  28.39 
 
 		 446 aa  48.1  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2530  wzy family polymerase, exosortase system type 1 associated  24.86 
 
 		 463 aa  48.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.42287  normal  0.0601314 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1310  hypothetical protein  26.49 
 
 		 439 aa  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0108  exopolysaccharide production protein, putative  28.12 
 
 		 441 aa  47.8  0.0004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21831  hypothetical protein  26.49 
 
 		 439 aa  47.8  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.285408 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0582  O-antigen polymerase  24.29 
 
 		 454 aa  47.8  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.814347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2455  O-antigen polymerase  23.26 
 
 		 435 aa  47  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0818595  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3094  O-antigen polymerase  27.68 
 
 		 444 aa  47  0.0007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3597  O-antigen polymerase  26.9 
 
 		 438 aa  47  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.312058 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4237  O-antigen polymerase  27.59 
 
 		 429 aa  46.6  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.201172  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0300  O-antigen polymerase  25.81 
 
 		 446 aa  45.8  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6004  O-antigen polymerase  23.98 
 
 		 424 aa  45.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.881514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0602  lipid A core--O-antigen ligase  31 
 
 		 416 aa  45.8  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4577  O-antigen polymerase  27.5 
 
 		 480 aa  45.8  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5652  O-antigen polymerase  31.79 
 
 		 426 aa  44.7  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1654  O-antigen polymerase  27.08 
 
 		 754 aa  44.7  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3526  O-antigen polymerase  29.15 
 
 		 668 aa  44.3  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000131402  normal  0.176407 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3695  hypothetical protein  22.93 
 
 		 404 aa  44.7  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3351  O-antigen polymerase  25.79 
 
 		 444 aa  44.3  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1650  hypothetical protein  22.93 
 
 		 404 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.192586  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0609  O-antigen polymerase  27.46 
 
 		 419 aa  44.3  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1285  O-antigen polymerase  23.93 
 
 		 418 aa  43.9  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0418  O-antigen polymerase  26.39 
 
 		 431 aa  44.3  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1569  O-antigen polymerase  23.39 
 
 		 489 aa  43.5  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.497135 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1314  O-antigen polymerase  23.93 
 
 		 418 aa  43.5  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.963126 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6494  O-antigen polymerase  22.93 
 
 		 424 aa  43.1  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1682  hypothetical protein  22.93 
 
 		 404 aa  43.5  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4808  O-antigen polymerase  28.8 
 
 		 391 aa  43.5  0.008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1614  hypothetical protein  22.93 
 
 		 404 aa  43.1  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.363158  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1468  secreted polysaccharide polymerase  22.93 
 
 		 404 aa  43.5  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00102355  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1496  hypothetical protein  22.93 
 
 		 404 aa  43.1  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.285071  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>