34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A0759 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A0759  O-antigen polymerase  100 
 
 		 430 aa  861    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.402812  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2006  O-antigen polymerase  33.77 
 
 		 426 aa  161  3e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.188841  normal  0.439827 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2401  O-antigen polymerase  33.22 
 
 		 426 aa  157  4e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0523174  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2204  hypothetical protein  31 
 
 		 435 aa  124  3e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.556953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0969  O-antigen polymerase  22.31 
 
 		 446 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.948168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0160  O-antigen ligase WaaL  26.67 
 
 		 408 aa  79.7  0.0000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0263  O-antigen ligase WaaL  26.67 
 
 		 408 aa  79.7  0.0000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04059  O-Antigen Polymerase family  29.2 
 
 		 425 aa  78.6  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0333  O-antigen polymerase  23.58 
 
 		 416 aa  77.4  0.0000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6004  O-antigen polymerase  29.52 
 
 		 424 aa  72.4  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.881514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2617  hypothetical protein  25.09 
 
 		 399 aa  70.1  0.00000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1511  O-antigen polymerase  25.24 
 
 		 436 aa  68.2  0.0000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.995807  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3581  O-antigen polymerase  31.07 
 
 		 429 aa  68.6  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.143797  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6494  O-antigen polymerase  27.27 
 
 		 424 aa  67.8  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0184  O-antigen polymerase  24.88 
 
 		 435 aa  63.5  0.000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.146439  normal  0.684402 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2478  O-antigen polymerase  26.96 
 
 		 415 aa  60.5  0.00000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0206  O-antigen polymerase  28.79 
 
 		 444 aa  60.5  0.00000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2712  O-antigen polymerase  26.67 
 
 		 413 aa  60.1  0.00000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0646679  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0319  O-antigen polymerase  25.12 
 
 		 422 aa  55.8  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0980  hypothetical protein  25.6 
 
 		 409 aa  56.2  0.000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0861  O-antigen polymerase  24.41 
 
 		 409 aa  55.5  0.000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2813  O-antigen polymerase  21.95 
 
 		 773 aa  54.3  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.192356  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3774  O-antigen polymerase  29.35 
 
 		 439 aa  52.8  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0392  O-antigen polymerase  29.57 
 
 		 398 aa  52  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000178586  normal  0.74185 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0083  O-antigen polymerase  26.06 
 
 		 419 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0973021  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0368  O-antigen polymerase  22.34 
 
 		 579 aa  48.5  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3103  O-antigen polymerase  25 
 
 		 498 aa  46.6  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.313581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1973  O-antigen polymerase  24.05 
 
 		 433 aa  45.8  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.15228 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2638  O-antigen polymerase  23.5 
 
 		 428 aa  45.1  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0267  O-antigen polymerase  24.81 
 
 		 430 aa  45.4  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1374  O-antigen polymerase  27.66 
 
 		 426 aa  45.8  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.247054  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0418  O-antigen polymerase  29.1 
 
 		 431 aa  45.1  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4374  O-antigen polymerase  24.1 
 
 		 410 aa  44.3  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1980  O-antigen polymerase  25.77 
 
 		 396 aa  43.9  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.638067 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>