31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_0980 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010577  XfasM23_0861  O-antigen polymerase  98.04 
 
 		 409 aa  780    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0980  hypothetical protein  100 
 
 		 409 aa  795    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04059  O-Antigen Polymerase family  52.67 
 
 		 425 aa  368  1e-100  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2712  O-antigen polymerase  30.15 
 
 		 413 aa  147  5e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0646679  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2401  O-antigen polymerase  28.3 
 
 		 426 aa  80.5  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0523174  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2006  O-antigen polymerase  27.65 
 
 		 426 aa  76.3  0.0000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.188841  normal  0.439827 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0319  O-antigen polymerase  27.25 
 
 		 422 aa  65.1  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0160  O-antigen ligase WaaL  29.44 
 
 		 408 aa  63.2  0.000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0263  O-antigen ligase WaaL  29.44 
 
 		 408 aa  63.2  0.000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2204  hypothetical protein  29.52 
 
 		 435 aa  61.2  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.556953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2617  hypothetical protein  23.24 
 
 		 399 aa  59.3  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3774  O-antigen polymerase  26.5 
 
 		 439 aa  56.2  0.0000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0759  O-antigen polymerase  26.48 
 
 		 430 aa  55.8  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.402812  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2478  O-antigen polymerase  28.25 
 
 		 415 aa  54.7  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4434  O-antigen polymerase  27.54 
 
 		 474 aa  51.2  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2813  O-antigen polymerase  23.53 
 
 		 773 aa  50.8  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.192356  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6494  O-antigen polymerase  24.29 
 
 		 424 aa  50.8  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0267  O-antigen polymerase  24.53 
 
 		 430 aa  50.4  0.00006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6004  O-antigen polymerase  24.46 
 
 		 424 aa  47.8  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.881514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0333  O-antigen polymerase  20.86 
 
 		 416 aa  47.4  0.0005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0152  hypothetical protein  26.79 
 
 		 389 aa  47.4  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3959  O-antigen polymerase  23.66 
 
 		 417 aa  46.6  0.0007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0194478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4049  O-antigen polymerase  25.33 
 
 		 417 aa  45.8  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0576542  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2737  O-antigen polymerase  31.58 
 
 		 542 aa  45.4  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0087  O-antigen polymerase  25.33 
 
 		 417 aa  45.1  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0556509  normal  0.17743 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3833  O-antigen polymerase  25.33 
 
 		 417 aa  45.1  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000244631  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2638  O-antigen polymerase  22.95 
 
 		 428 aa  45.4  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4125  O-antigen polymerase  25.33 
 
 		 417 aa  45.1  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.314741  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1511  O-antigen polymerase  25.78 
 
 		 436 aa  44.3  0.004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.995807  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0853  hypothetical protein  22.92 
 
 		 416 aa  43.1  0.008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3077  O-antigen polymerase  26.47 
 
 		 504 aa  43.1  0.01  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>