94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2638 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2638  O-antigen polymerase  100 
 
 		 428 aa  845    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2896  O-antigen polymerase family protein  26.94 
 
 		 686 aa  68.6  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2516  O-antigen polymerase  26.94 
 
 		 686 aa  68.6  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.549504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4116  O-antigen polymerase  28.26 
 
 		 540 aa  67.8  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0014553  hitchhiker  0.00000561153 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04059  O-Antigen Polymerase family  22.41 
 
 		 425 aa  63.2  0.000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4434  O-antigen polymerase  30.84 
 
 		 474 aa  62  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3580  O-antigen polymerase  26.36 
 
 		 504 aa  60.1  0.00000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18850  O-antigen polymerase  29.01 
 
 		 393 aa  60.1  0.00000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0287  O-antigen polymerase  24.86 
 
 		 415 aa  59.3  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.509541  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3113  O-antigen polymerase  26.71 
 
 		 467 aa  58.2  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000265772  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1788  O-antigen polymerase  25.14 
 
 		 446 aa  57.4  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4268  O-antigen polymerase  30.39 
 
 		 503 aa  57  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.209068 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0142  O-antigen polymerase  26.96 
 
 		 496 aa  57  0.0000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4227  O-antigen polymerase  26.01 
 
 		 457 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4286  inorganic carbon transporter  26.01 
 
 		 457 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.816665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02624  membrane protein  32.41 
 
 		 431 aa  56.2  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0845  hypothetical protein  27.01 
 
 		 537 aa  55.1  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.149779  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0515  O-antigen polymerase  27.36 
 
 		 1090 aa  55.5  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0340666  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1087  O-antigen polymerase  26.58 
 
 		 612 aa  55.5  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0083  membrane protein  30.13 
 
 		 443 aa  55.1  0.000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.735968  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02223  hypothetical protein  26.46 
 
 		 461 aa  54.3  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003538  putative membrane protein of ExoQ family involved in exopolysaccharide production  28.76 
 
 		 454 aa  54.3  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0456  hypothetical protein  23.62 
 
 		 438 aa  53.9  0.000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0069  O-antigen polymerase  30.13 
 
 		 443 aa  53.9  0.000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0583  O-antigen polymerase  25.44 
 
 		 449 aa  53.9  0.000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66100  hypothetical protein  26.9 
 
 		 399 aa  53.5  0.000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1869  O-antigen polymerase  23.98 
 
 		 459 aa  53.1  0.000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0714  O-antigen polymerase  25.52 
 
 		 781 aa  52.4  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1682  hypothetical protein  27.54 
 
 		 404 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2177  EXOQ family/lipid A core O-antigen ligase  24.65 
 
 		 495 aa  52.8  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.42634  normal  0.835874 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1186  Tetratricopeptide domain protein  25.75 
 
 		 829 aa  52.4  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0301041  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1614  hypothetical protein  27.87 
 
 		 404 aa  52  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.363158  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1468  secreted polysaccharide polymerase  27.3 
 
 		 404 aa  52  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00102355  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1496  hypothetical protein  27.87 
 
 		 404 aa  52  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.285071  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1650  hypothetical protein  27.81 
 
 		 404 aa  50.4  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.192586  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3695  hypothetical protein  32.21 
 
 		 404 aa  50.1  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2459  O-antigen polymerase  20.57 
 
 		 437 aa  50.1  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2455  O-antigen polymerase  27.5 
 
 		 435 aa  49.7  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0818595  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2212  O-antigen polymerase  26.03 
 
 		 415 aa  49.3  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0880149  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2009  O-antigen polymerase  22.56 
 
 		 459 aa  49.3  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0364  O-antigen polymerase  24.86 
 
 		 428 aa  49.3  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0234  O-antigen polymerase  26.99 
 
 		 402 aa  48.5  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2813  O-antigen polymerase  27.56 
 
 		 773 aa  48.9  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.192356  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1374  O-antigen polymerase  25.36 
 
 		 426 aa  48.9  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.247054  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0446  O-antigen polymerase  26.15 
 
 		 1070 aa  48.9  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0152  hypothetical protein  24.87 
 
 		 389 aa  48.1  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2346  O-antigen polymerase  26.47 
 
 		 481 aa  47.8  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1388  O-antigen polymerase  25 
 
 		 452 aa  47.8  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3103  O-antigen polymerase  26.76 
 
 		 498 aa  47.8  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.313581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1077  O-antigen polymerase  23.81 
 
 		 433 aa  47.4  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.9264  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3375  O-antigen polymerase  21.38 
 
 		 432 aa  47.4  0.0005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.221665  normal  0.11504 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0657  O-antigen polymerase  21.72 
 
 		 588 aa  47.4  0.0005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0056678  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4213  O-antigen polymerase  36.36 
 
 		 430 aa  47.4  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.144935  normal  0.568033 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2018  O-antigen polymerase  30.93 
 
 		 456 aa  46.6  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1184  O-antigen polymerase  26.8 
 
 		 412 aa  46.6  0.0008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2053  O-antigen polymerase  24.29 
 
 		 405 aa  46.6  0.0008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2760  hypothetical protein  26.26 
 
 		 487 aa  46.2  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3347  O-antigen polymerase  31.13 
 
 		 443 aa  46.2  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3078  O-antigen polymerase  24.71 
 
 		 500 aa  46.2  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1940  O-antigen polymerase  27.66 
 
 		 453 aa  46.2  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3526  O-antigen polymerase  27.49 
 
 		 668 aa  45.8  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000131402  normal  0.176407 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0024  O-antigen polymerase  21.2 
 
 		 456 aa  45.8  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0168  O-antigen polymerase  25.68 
 
 		 400 aa  45.8  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0508  O-antigen polymerase  28.74 
 
 		 440 aa  45.4  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1429  O-antigen polymerase  31.54 
 
 		 405 aa  45.4  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4110  O-antigen polymerase  30.91 
 
 		 930 aa  45.1  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0614  hypothetical protein  26.5 
 
 		 759 aa  44.7  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.865604  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0301  O-antigen polymerase  23.08 
 
 		 464 aa  44.7  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02473  O-antigen polymerase  22.41 
 
 		 470 aa  45.1  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2375  O-antigen polymerase  25.9 
 
 		 500 aa  45.1  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1654  O-antigen polymerase  24.02 
 
 		 754 aa  45.1  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0615  hypothetical protein  26.5 
 
 		 703 aa  44.7  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.370403  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2712  O-antigen polymerase  31.25 
 
 		 413 aa  44.3  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0646679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3061  O-antigen polymerase  33.33 
 
 		 465 aa  44.3  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.433121  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1511  O-antigen polymerase  27.07 
 
 		 436 aa  44.3  0.004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.995807  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0065  O-antigen polymerase  22.86 
 
 		 502 aa  44.3  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.321315  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2251  O-antigen polymerase  23.63 
 
 		 561 aa  44.7  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.220671  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0274  O-antigen polymerase  21.97 
 
 		 444 aa  44.3  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2501  O-antigen polymerase  22.37 
 
 		 784 aa  44.3  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3570  O-antigen polymerase  25.66 
 
 		 472 aa  44.3  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.808041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1888  hypothetical protein  32.47 
 
 		 415 aa  44.3  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001320  capsular polysaccharide synthesis enzyme cpsG Lipid A core - O-antigen ligase  26.14 
 
 		 417 aa  44.3  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0357  inorganic carbon transporter  20.25 
 
 		 467 aa  43.9  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.152421  normal  0.510876 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5667  putative O-antigen ligase  23.29 
 
 		 427 aa  43.5  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304337  normal  0.482234 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0861  O-antigen polymerase  26.22 
 
 		 409 aa  43.9  0.006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2694  O-antigen polymerase  24.2 
 
 		 532 aa  43.9  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00327343  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6494  O-antigen polymerase  24.77 
 
 		 424 aa  43.5  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0063  O-antigen polymerase  22.28 
 
 		 531 aa  43.5  0.007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0639643 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2436  O-antigen polymerase  34.67 
 
 		 894 aa  43.5  0.007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4808  O-antigen polymerase  24.04 
 
 		 391 aa  43.5  0.008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0127  hypothetical protein  26.05 
 
 		 845 aa  43.1  0.009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1699  O-antigen polymerase  24.41 
 
 		 401 aa  43.1  0.009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2284  O-antigen polymerase  24.55 
 
 		 452 aa  43.1  0.009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3951  O-antigen polymerase  28.37 
 
 		 402 aa  43.1  0.01  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>