43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0274 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0274  O-antigen polymerase  100 
 
 		 444 aa  898    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0304  O-antigen polymerase  56.21 
 
 		 451 aa  497  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0892  O-antigen polymerase  28.74 
 
 		 428 aa  84  0.000000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0864328  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4842  O-antigen polymerase  25 
 
 		 433 aa  78.6  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000342709  normal  0.0564871 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1688  O-antigen polymerase  26.37 
 
 		 421 aa  74.3  0.000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0910283  normal  0.076767 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1531  O-antigen polymerase  27.43 
 
 		 419 aa  72.4  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.543111  normal  0.517094 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1380  O-antigen polymerase  27.37 
 
 		 313 aa  72  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.563149  normal  0.0271558 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1595  O-antigen polymerase  29.55 
 
 		 467 aa  70.9  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2821  O-antigen polymerase  25.98 
 
 		 437 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6427  O-antigen polymerase  26.75 
 
 		 439 aa  68.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.445902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1179  O-antigen polymerase  27.18 
 
 		 446 aa  67.8  0.0000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3696  O-antigen polymerase  29.35 
 
 		 417 aa  66.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0487808  normal  0.621123 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2587  O-antigen polymerase  28.09 
 
 		 409 aa  65.5  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0963  O-antigen polymerase  23.35 
 
 		 460 aa  64.7  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.18005  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6232  O-antigen polymerase  26.82 
 
 		 441 aa  64.7  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.394036  normal  0.503415 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1176  O-antigen polymerase  25.63 
 
 		 433 aa  63.9  0.000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3184  O-antigen polymerase  25.9 
 
 		 442 aa  62  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4801  O-antigen polymerase  28.86 
 
 		 440 aa  62  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.141517 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1130  O-antigen polymerase  28.3 
 
 		 438 aa  60.1  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0665  O-antigen polymerase  33.33 
 
 		 436 aa  59.7  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.658587 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3343  O-antigen polymerase  25.37 
 
 		 401 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2875  O-antigen polymerase  25 
 
 		 440 aa  58.5  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.184555  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4944  O-antigen polymerase  27.45 
 
 		 434 aa  58.5  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.367217  normal  0.330229 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4354  O-antigen polymerase  28.1 
 
 		 443 aa  56.2  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.201605  normal  0.814699 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0108  exopolysaccharide production protein, putative  27.89 
 
 		 441 aa  53.9  0.000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0388  O-antigen polymerase  27.05 
 
 		 358 aa  53.5  0.000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1378  O-antigen polymerase  24.84 
 
 		 416 aa  52.8  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.486003  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5938  exopolysaccharide production protein  27.48 
 
 		 425 aa  52.8  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1077  O-antigen polymerase  24.55 
 
 		 440 aa  51.6  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.7973  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2212  O-antigen polymerase  28.79 
 
 		 415 aa  51.2  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0880149  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2886  O-antigen ligase-like  24 
 
 		 414 aa  50.4  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000199013  normal  0.062273 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1654  O-antigen polymerase  24.85 
 
 		 754 aa  50.1  0.00008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4237  O-antigen polymerase  34.72 
 
 		 429 aa  48.9  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.201172  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0810  O-antigen polymerase  28.21 
 
 		 441 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.319403 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4579  O-antigen polymerase  30.95 
 
 		 448 aa  47.4  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.17078 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1091  exopolysaccharide production protein  25.38 
 
 		 429 aa  47.4  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.802391  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0651  O-antigen polymerase  32.67 
 
 		 428 aa  46.2  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2194  O-antigen polymerase  24.18 
 
 		 582 aa  45.8  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.782503 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1691  O-antigen polymerase  23.11 
 
 		 512 aa  44.7  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.121195  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2638  O-antigen polymerase  21.97 
 
 		 428 aa  44.7  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0266  FeS assembly protein SufB  28.57 
 
 		 470 aa  44.3  0.005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0582539  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0844  O-antigen polymerase  24.54 
 
 		 556 aa  43.9  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153781 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4530  O-antigen polymerase  25.11 
 
 		 444 aa  43.1  0.009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>