38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3347 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_3347  O-antigen polymerase  100 
 
 		 443 aa  854    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02624  membrane protein  62.12 
 
 		 431 aa  492  9.999999999999999e-139  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0069  O-antigen polymerase  58.56 
 
 		 443 aa  437  1e-121  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0083  membrane protein  57.87 
 
 		 443 aa  435  1e-121  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.735968  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1888  hypothetical protein  31.86 
 
 		 415 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2813  O-antigen polymerase  25.25 
 
 		 773 aa  67  0.0000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.192356  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3103  O-antigen polymerase  31.49 
 
 		 498 aa  60.8  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.313581  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2006  O-antigen polymerase  32.41 
 
 		 426 aa  54.7  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.188841  normal  0.439827 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2375  O-antigen polymerase  30.94 
 
 		 500 aa  53.9  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2638  O-antigen polymerase  26.52 
 
 		 428 aa  53.5  0.000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1851  hypothetical protein  25.15 
 
 		 429 aa  53.1  0.00001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0338  O-antigen ligase  24.54 
 
 		 436 aa  51.6  0.00003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18850  O-antigen polymerase  29.35 
 
 		 393 aa  50.8  0.00005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4434  O-antigen polymerase  30.83 
 
 		 474 aa  50.1  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5482  hypothetical protein  31.61 
 
 		 545 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.406542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1087  O-antigen polymerase  25.85 
 
 		 612 aa  48.1  0.0003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3695  hypothetical protein  35.71 
 
 		 404 aa  47.4  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1650  hypothetical protein  35.71 
 
 		 404 aa  47.4  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.192586  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1682  hypothetical protein  35.71 
 
 		 404 aa  47  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2523  O-antigen polymerase  29.47 
 
 		 738 aa  47  0.0007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0830151  hitchhiker  0.00448531 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1468  secreted polysaccharide polymerase  31.52 
 
 		 404 aa  46.6  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00102355  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4227  O-antigen polymerase  28.41 
 
 		 457 aa  47  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4286  inorganic carbon transporter  28.41 
 
 		 457 aa  46.6  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.816665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2401  O-antigen polymerase  29.37 
 
 		 426 aa  46.6  0.0008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0523174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1614  hypothetical protein  31.52 
 
 		 404 aa  46.6  0.0008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.363158  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1496  hypothetical protein  31.52 
 
 		 404 aa  46.6  0.0008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.285071  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0388  O-antigen polymerase  36.36 
 
 		 358 aa  46.6  0.0009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4957  O-antigen polymerase  26.24 
 
 		 470 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2212  O-antigen polymerase  29.2 
 
 		 415 aa  46.6  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0880149  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1374  O-antigen polymerase  24.86 
 
 		 426 aa  45.4  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.247054  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2125  O-antigen polymerase  25.47 
 
 		 425 aa  45.4  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0474  O-antigen polymerase  33.08 
 
 		 595 aa  44.7  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4116  O-antigen polymerase  28.49 
 
 		 540 aa  45.1  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0014553  hitchhiker  0.00000561153 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04059  O-Antigen Polymerase family  29.75 
 
 		 425 aa  44.3  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3371  O-antigen polymerase  25.13 
 
 		 413 aa  44.7  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0364  O-antigen polymerase  25 
 
 		 428 aa  44.7  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0287  O-antigen polymerase  22.68 
 
 		 415 aa  44.3  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.509541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2501  O-antigen polymerase  25.74 
 
 		 784 aa  43.5  0.007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>