20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5482 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_5482  hypothetical protein  100 
 
 		 545 aa  1041    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.406542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3180  O-antigen polymerase  31.34 
 
 		 498 aa  84.3  0.000000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3401  polysaccharide deacetylase  27.33 
 
 		 464 aa  66.6  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.264275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4026  O-antigen polymerase  31.63 
 
 		 499 aa  62.4  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2077  hypothetical protein  23.44 
 
 		 510 aa  58.9  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4530  O-antigen polymerase  34 
 
 		 444 aa  56.6  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2722  O-antigen polymerase  29.07 
 
 		 497 aa  55.1  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.616494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4434  O-antigen polymerase  25.19 
 
 		 474 aa  55.1  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3579  O-antigen polymerase  24.44 
 
 		 501 aa  52.4  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2653  O-antigen polymerase  29.62 
 
 		 499 aa  51.6  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1654  O-antigen polymerase  28.73 
 
 		 754 aa  51.6  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0142  O-antigen polymerase  23.6 
 
 		 496 aa  50.4  0.00008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4268  O-antigen polymerase  27.6 
 
 		 503 aa  50.1  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.209068 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1088  O-antigen polymerase  24.62 
 
 		 737 aa  46.2  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4116  O-antigen polymerase  26.64 
 
 		 540 aa  45.4  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0014553  hitchhiker  0.00000561153 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3537  membrane protein PslJ  26.76 
 
 		 471 aa  45.4  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0975897  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3103  O-antigen polymerase  29.15 
 
 		 498 aa  45.1  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.313581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1788  O-antigen polymerase  31.78 
 
 		 446 aa  44.7  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0654  O-antigen polymerase  28.25 
 
 		 480 aa  44.3  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00317709 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2384  O-antigen polymerase  24.76 
 
 		 436 aa  43.9  0.007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.486663  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>