22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4026 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_3180  O-antigen polymerase  85.57 
 
 
498 aa  745    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4026  O-antigen polymerase  100 
 
 
499 aa  960    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5482  hypothetical protein  30.41 
 
 
545 aa  87.4  5e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.406542  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3579  O-antigen polymerase  26.22 
 
 
501 aa  62  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4434  O-antigen polymerase  28.36 
 
 
474 aa  55.5  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3103  O-antigen polymerase  27.44 
 
 
498 aa  53.5  0.000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.313581  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0508  O-antigen polymerase  35.42 
 
 
440 aa  51.6  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1869  O-antigen polymerase  27.95 
 
 
459 aa  50.8  0.00006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0822  inorganic carbon transporter  23.92 
 
 
471 aa  48.9  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.999427  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3002  hypothetical protein  28.41 
 
 
441 aa  49.3  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.449759 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1088  O-antigen polymerase  23.79 
 
 
737 aa  47.8  0.0005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0279  bicarbonate transporter  34.05 
 
 
438 aa  47.8  0.0005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0609  O-antigen polymerase  24.34 
 
 
419 aa  47.8  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02624  membrane protein  27.69 
 
 
431 aa  46.6  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2375  O-antigen polymerase  25 
 
 
500 aa  46.2  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4864  inorganic carbon transporter  28.3 
 
 
467 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.867776  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4227  O-antigen polymerase  29.01 
 
 
457 aa  45.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4286  inorganic carbon transporter  29.01 
 
 
457 aa  45.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.816665  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0142  O-antigen polymerase  28.92 
 
 
496 aa  44.7  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0357  inorganic carbon transporter  28.39 
 
 
467 aa  44.3  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.152421  normal  0.510876 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0234  O-antigen polymerase  27.8 
 
 
402 aa  43.9  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0845  hypothetical protein  26.98 
 
 
537 aa  43.5  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.149779  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>