84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3579 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_3579  O-antigen polymerase  100 
 
 		 501 aa  1016    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2375  O-antigen polymerase  27.77 
 
 		 500 aa  182  1e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3103  O-antigen polymerase  27.27 
 
 		 498 aa  179  1e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.313581  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2459  O-antigen polymerase  27.67 
 
 		 437 aa  79  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3401  polysaccharide deacetylase  21.38 
 
 		 464 aa  77.4  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.264275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1955  O-antigen polymerase  23.85 
 
 		 468 aa  76.3  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.324728  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0301  O-antigen polymerase  23.86 
 
 		 464 aa  74.7  0.000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2412  hypothetical protein  27.21 
 
 		 444 aa  72.8  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2018  O-antigen polymerase  23.25 
 
 		 456 aa  72.4  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003538  putative membrane protein of ExoQ family involved in exopolysaccharide production  24.5 
 
 		 454 aa  69.3  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1497  O-antigen polymerase  25.31 
 
 		 672 aa  68.9  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5249  O-antigen polymerase  27.05 
 
 		 671 aa  67.8  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.566036  normal  0.80633 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3526  O-antigen polymerase  25.27 
 
 		 668 aa  67.8  0.0000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000131402  normal  0.176407 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2530  wzy family polymerase, exosortase system type 1 associated  25.32 
 
 		 463 aa  67  0.0000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.42287  normal  0.0601314 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1650  hypothetical protein  27.48 
 
 		 404 aa  66.6  0.0000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.192586  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2384  O-antigen polymerase  27.27 
 
 		 436 aa  65.5  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.486663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02223  hypothetical protein  21.23 
 
 		 461 aa  65.1  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1788  O-antigen polymerase  25.21 
 
 		 446 aa  65.1  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1682  hypothetical protein  25.75 
 
 		 404 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3695  hypothetical protein  26.02 
 
 		 404 aa  64.7  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18850  O-antigen polymerase  25.21 
 
 		 393 aa  63.5  0.000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1614  hypothetical protein  26.01 
 
 		 404 aa  63.5  0.000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.363158  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1496  hypothetical protein  26.01 
 
 		 404 aa  63.5  0.000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.285071  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1468  secreted polysaccharide polymerase  26.01 
 
 		 404 aa  63.2  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00102355  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0364  O-antigen polymerase  24.27 
 
 		 428 aa  61.6  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0119  O-antigen polymerase  24.36 
 
 		 466 aa  60.8  0.00000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0142  O-antigen polymerase  25.2 
 
 		 496 aa  55.8  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0677  O-antigen polymerase  30.05 
 
 		 436 aa  55.5  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.857845  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2608  O-antigen polymerase  22.68 
 
 		 432 aa  53.9  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.212106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4116  O-antigen polymerase  25.28 
 
 		 540 aa  53.9  0.000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0014553  hitchhiker  0.00000561153 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2338  O-antigen polymerase  23.3 
 
 		 425 aa  53.9  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4434  O-antigen polymerase  26.58 
 
 		 474 aa  53.5  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3180  O-antigen polymerase  26.14 
 
 		 498 aa  53.1  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0508  O-antigen polymerase  28.74 
 
 		 440 aa  52.8  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3268  wzy family polymerase, exosortase system type 1 associated  25.42 
 
 		 452 aa  52  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.869746  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2212  O-antigen polymerase  24.31 
 
 		 415 aa  52.4  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0880149  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4268  O-antigen polymerase  26.15 
 
 		 503 aa  52.4  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.209068 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2009  O-antigen polymerase  21.69 
 
 		 459 aa  52.4  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1804  hypothetical protein  25.41 
 
 		 410 aa  52  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0307014 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3580  O-antigen polymerase  28.89 
 
 		 504 aa  52  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5004  O-antigen polymerase family protein  22.53 
 
 		 436 aa  51.6  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3094  O-antigen polymerase  25.7 
 
 		 444 aa  50.8  0.00005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1088  O-antigen polymerase  25 
 
 		 737 aa  50.8  0.00005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1940  O-antigen polymerase  23.64 
 
 		 453 aa  50.4  0.00008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4864  inorganic carbon transporter  25.5 
 
 		 467 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.867776  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0586  O-antigen polymerase  25.43 
 
 		 459 aa  49.7  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000335873  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24401  bicarbonate transporter, ICT family protein  26.7 
 
 		 436 aa  48.5  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1384  TPR repeat-containing protein  23.02 
 
 		 870 aa  48.5  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000149301  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5482  hypothetical protein  32.35 
 
 		 545 aa  47.8  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.406542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0582  O-antigen polymerase  24.5 
 
 		 454 aa  47.8  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.814347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2694  O-antigen polymerase  21.94 
 
 		 532 aa  47.8  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00327343  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1954  hypothetical protein  20.4 
 
 		 443 aa  47.4  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0024  O-antigen polymerase  21.94 
 
 		 456 aa  47.8  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2327  O-antigen polymerase  22.97 
 
 		 475 aa  46.2  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2808  O-antigen polymerase  23.53 
 
 		 494 aa  46.6  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3018  O-antigen polymerase  22.17 
 
 		 446 aa  46.2  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3061  O-antigen polymerase  27.56 
 
 		 465 aa  47  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.433121  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0657  O-antigen polymerase  25.69 
 
 		 593 aa  47  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3113  O-antigen polymerase  22.59 
 
 		 467 aa  45.8  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000265772  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0821  O-antigen polymerase family protein  27.21 
 
 		 595 aa  45.8  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1639  hypothetical protein  20.95 
 
 		 447 aa  45.8  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1654  O-antigen polymerase  28.71 
 
 		 754 aa  45.8  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0051  O-antigen polymerase  29.71 
 
 		 735 aa  45.1  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000539528  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05350  O-antigen polymerase, Wzy protein  26.63 
 
 		 467 aa  45.1  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00185086  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0279  O-antigen polymerase family protein  27.21 
 
 		 595 aa  44.7  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.297863  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2679  O-antigen polymerase family protein  27.21 
 
 		 595 aa  44.7  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0980  O-antigen polymerase family protein  27.21 
 
 		 661 aa  44.7  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2397  O-antigen polymerase family protein  27.21 
 
 		 595 aa  44.7  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.233574  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0010  O-antigen polymerase family protein  27.21 
 
 		 595 aa  44.7  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0817  O-antigen polymerase family protein  27.21 
 
 		 595 aa  44.7  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1691  O-antigen polymerase  24.26 
 
 		 512 aa  44.7  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.121195  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0822  inorganic carbon transporter  22.14 
 
 		 471 aa  44.3  0.005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.999427  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0650  O-antigen polymerase family protein  32.53 
 
 		 595 aa  44.3  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0152  hypothetical protein  27.22 
 
 		 389 aa  43.9  0.007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0845  hypothetical protein  24.14 
 
 		 537 aa  43.9  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.149779  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0103  O-antigen polymerase  23.62 
 
 		 492 aa  43.9  0.007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4126  O-antigen polymerase  22.83 
 
 		 440 aa  43.9  0.007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0679  O-antigen polymerase  27.89 
 
 		 437 aa  43.9  0.007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4995  lipid A-core:surface polymer ligase  25.93 
 
 		 402 aa  43.9  0.007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.150422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2034  O-antigen polymerase  25 
 
 		 592 aa  43.5  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2645  O-antigen polymerase  25 
 
 		 592 aa  43.5  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2896  O-antigen polymerase family protein  24.89 
 
 		 686 aa  43.5  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2516  O-antigen polymerase  24.89 
 
 		 686 aa  43.5  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.549504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2674  O-antigen polymerase  25 
 
 		 592 aa  43.5  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>