16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_4126 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_4126  O-antigen polymerase  100 
 
 
440 aa  857    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2697  O-antigen polymerase  39.76 
 
 
419 aa  267  2.9999999999999995e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8491  O-antigen polymerase  36.89 
 
 
469 aa  223  4e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.867737 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1927  O-antigen polymerase  36.36 
 
 
679 aa  206  5e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1569  O-antigen polymerase  38.5 
 
 
489 aa  189  5.999999999999999e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.497135 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1739  O-antigen polymerase  31.95 
 
 
465 aa  185  1.0000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0753  O-antigen polymerase  36.99 
 
 
476 aa  183  5.0000000000000004e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.409596  hitchhiker  0.000594246 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4472  hypothetical protein  33.33 
 
 
509 aa  171  2e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0648  hypothetical protein  33.33 
 
 
462 aa  171  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.600049  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6554  O-antigen polymerase  33.41 
 
 
506 aa  169  1e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.408434 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3905  O-antigen polymerase  32.23 
 
 
456 aa  141  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0066  O-antigen polymerase  32.41 
 
 
438 aa  115  1.0000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.059458  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1072  hypothetical protein  28.62 
 
 
457 aa  85.5  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.285493  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3579  O-antigen polymerase  22.65 
 
 
501 aa  48.5  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2384  O-antigen polymerase  25.93 
 
 
436 aa  43.5  0.007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.486663  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0654  O-antigen polymerase  27.59 
 
 
480 aa  43.1  0.009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00317709 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>