15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1072 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1072  hypothetical protein  100 
 
 		 457 aa  882    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.285493  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0066  O-antigen polymerase  39.76 
 
 		 438 aa  238  2e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.059458  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1739  O-antigen polymerase  29.32 
 
 		 465 aa  116  8.999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0648  hypothetical protein  29.45 
 
 		 462 aa  110  7.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.600049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8491  O-antigen polymerase  27.39 
 
 		 469 aa  95.9  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.867737 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4126  O-antigen polymerase  31.23 
 
 		 440 aa  88.2  3e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6554  O-antigen polymerase  28.71 
 
 		 506 aa  85.5  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.408434 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1569  O-antigen polymerase  30.1 
 
 		 489 aa  83.2  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.497135 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1927  O-antigen polymerase  27.46 
 
 		 679 aa  82  0.00000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4472  hypothetical protein  28.46 
 
 		 509 aa  82.4  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2697  O-antigen polymerase  29.43 
 
 		 419 aa  81.6  0.00000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0753  O-antigen polymerase  26.97 
 
 		 476 aa  75.9  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.409596  hitchhiker  0.000594246 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3905  O-antigen polymerase  25.74 
 
 		 456 aa  72.8  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2375  O-antigen polymerase  26.46 
 
 		 500 aa  44.3  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2379  hypothetical protein  31.09 
 
 		 501 aa  43.5  0.008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>