14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4472 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_4472  hypothetical protein  100 
 
 
509 aa  1010    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0753  O-antigen polymerase  40.05 
 
 
476 aa  251  3e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.409596  hitchhiker  0.000594246 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1569  O-antigen polymerase  39.18 
 
 
489 aa  208  2e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.497135 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6554  O-antigen polymerase  37.85 
 
 
506 aa  208  2e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.408434 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1927  O-antigen polymerase  37.96 
 
 
679 aa  204  4e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0648  hypothetical protein  34.25 
 
 
462 aa  184  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.600049  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1739  O-antigen polymerase  30.77 
 
 
465 aa  173  5.999999999999999e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8491  O-antigen polymerase  31.05 
 
 
469 aa  160  4e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.867737 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2697  O-antigen polymerase  31.49 
 
 
419 aa  148  2.0000000000000003e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3905  O-antigen polymerase  29.84 
 
 
456 aa  136  8e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4126  O-antigen polymerase  34.07 
 
 
440 aa  136  9.999999999999999e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0066  O-antigen polymerase  25.21 
 
 
438 aa  89.4  1e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.059458  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1072  hypothetical protein  25.52 
 
 
457 aa  72.4  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.285493  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4494  hypothetical protein  23.38 
 
 
447 aa  47  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00401546  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>