13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2697 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_2697  O-antigen polymerase  100 
 
 
419 aa  825    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4126  O-antigen polymerase  40.91 
 
 
440 aa  241  2e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8491  O-antigen polymerase  33.02 
 
 
469 aa  171  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.867737 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4472  hypothetical protein  31.49 
 
 
509 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1739  O-antigen polymerase  29.38 
 
 
465 aa  159  6e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0753  O-antigen polymerase  33.41 
 
 
476 aa  152  8e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.409596  hitchhiker  0.000594246 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1927  O-antigen polymerase  31.73 
 
 
679 aa  146  5e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0648  hypothetical protein  29.83 
 
 
462 aa  146  6e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.600049  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1569  O-antigen polymerase  30.34 
 
 
489 aa  143  6e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.497135 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6554  O-antigen polymerase  29.29 
 
 
506 aa  121  3e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.408434 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3905  O-antigen polymerase  27.29 
 
 
456 aa  110  3e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1072  hypothetical protein  27.27 
 
 
457 aa  80.1  0.00000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.285493  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0066  O-antigen polymerase  27.89 
 
 
438 aa  80.1  0.00000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.059458  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>