18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6554 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6554  O-antigen polymerase  100 
 
 		 506 aa  978    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.408434 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1569  O-antigen polymerase  63.33 
 
 		 489 aa  535  1e-151  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.497135 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4472  hypothetical protein  37.87 
 
 		 509 aa  225  1e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0753  O-antigen polymerase  37.16 
 
 		 476 aa  209  1e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.409596  hitchhiker  0.000594246 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0648  hypothetical protein  37.43 
 
 		 462 aa  191  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.600049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1927  O-antigen polymerase  36.18 
 
 		 679 aa  178  2e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1739  O-antigen polymerase  30.83 
 
 		 465 aa  169  9e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8491  O-antigen polymerase  32.61 
 
 		 469 aa  161  3e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.867737 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4126  O-antigen polymerase  34.97 
 
 		 440 aa  151  3e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2697  O-antigen polymerase  29.22 
 
 		 419 aa  120  3.9999999999999996e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3905  O-antigen polymerase  28.25 
 
 		 456 aa  117  5e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0066  O-antigen polymerase  26.46 
 
 		 438 aa  89.7  1e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.059458  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1072  hypothetical protein  28.71 
 
 		 457 aa  89.4  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.285493  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4268  O-antigen polymerase  25.51 
 
 		 503 aa  51.6  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.209068 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3579  O-antigen polymerase  25.6 
 
 		 501 aa  48.9  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3580  O-antigen polymerase  24.72 
 
 		 504 aa  46.6  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0267  O-antigen polymerase  22.84 
 
 		 430 aa  44.7  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3309  hypothetical protein  29.51 
 
 		 471 aa  44.3  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.110006  normal  0.406179 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>