20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3905 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_3905  O-antigen polymerase  100 
 
 
456 aa  902    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0648  hypothetical protein  32.02 
 
 
462 aa  155  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.600049  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4472  hypothetical protein  29.84 
 
 
509 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1739  O-antigen polymerase  29.94 
 
 
465 aa  134  3e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1569  O-antigen polymerase  31.83 
 
 
489 aa  131  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.497135 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4126  O-antigen polymerase  33.64 
 
 
440 aa  123  7e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1927  O-antigen polymerase  27.6 
 
 
679 aa  117  3.9999999999999997e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8491  O-antigen polymerase  28.68 
 
 
469 aa  117  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.867737 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0753  O-antigen polymerase  31.51 
 
 
476 aa  112  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.409596  hitchhiker  0.000594246 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6554  O-antigen polymerase  27.9 
 
 
506 aa  108  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.408434 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2697  O-antigen polymerase  27.01 
 
 
419 aa  103  8e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1072  hypothetical protein  25.41 
 
 
457 aa  80.5  0.00000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.285493  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0066  O-antigen polymerase  25.5 
 
 
438 aa  76.6  0.0000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.059458  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02890  hypothetical protein  27.24 
 
 
442 aa  59.3  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1208  O-antigen polymerase  20.27 
 
 
426 aa  49.7  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1497  O-antigen polymerase  26.21 
 
 
672 aa  47.4  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3696  O-antigen polymerase  25.1 
 
 
461 aa  46.2  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.312837 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4864  inorganic carbon transporter  35.51 
 
 
467 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.867776  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5249  O-antigen polymerase  24.56 
 
 
671 aa  45.4  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.566036  normal  0.80633 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4494  hypothetical protein  24.9 
 
 
447 aa  43.5  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00401546  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>